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J-GLOBAL ID：201602289423994936   整理番号：16A1244277

長鎖非コードRNA肺腺癌転移関連転写1本仲介の内因性競合的RNAネットワーク研究【JST・京大機械翻訳】

Competing endogenous RNA network mediated by long non-coding RNA metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1

著者 (5件)： Zhang Haitian (Department of Clinical Medicine, Xuzhou Medical University) ,  Wang Guoxiang (Department of Cardiothoracic Surgery, Affiliated Hospital of Xuzhou Medical University) ,  Yin Rong (Department of Thoracic Surgery, Nanjing Medical University Affiliated Cancer Hospital, Jiangsu Key Laboratory of Molecular and Translational Cancer Research, Cancer Institute of Jiangsu Province) ,  Qiu Mantang (Department of Thoracic Surgery, Nanjing Medical University Affiliated Cancer Hospital, Jiangsu Key Laboratory of Molecular and Translational Cancer Research, Cancer Institute of Jiangsu Province) ,  Xu Lin (Department of Thoracic Surgery, Nanjing Medical University Affiliated Cancer Hospital, Jiangsu Key Laboratory of Molecular and Translational Cancer Research, Cancer Institute of Jiangsu Province)
資料名： Zhonghua Shiyan Waike Zazhi  (Zhonghua Shiyan Waike Zazhi)
巻： 33  号： 8  ページ： 1924-1926  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2337A  ISSN： 1001-9030  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】生物情報法を用いて,非コード化肺腺癌転移関連転写1(MALAT1)によって仲介される内因性競合的RNA(CERNA)ネットワークを構築する。方法:MIRANDAアルゴリズムにより、MALAT1配列に1個の微小RNA(MIRNAS、MIR)結合部位が存在することが予測された。STARBASE1の紫外線架橋免疫共沈降-高スループット配列決定(CLIP-SEQ)データをSTARBASEデータベースによってダウンロードした。MIRTARBASEを検索し、文献で実証されたMIRNA標的遺伝子5個をスクリーニングした。ダウンロードデータベースにおいてMALAT1発現と正の相関がある遺伝子528個をダウンロードした。結果:MIRANDAアルゴリズムにより、MALAT1配列に1個のMIRNA結合部位が存在し、MALAT1のCLIP-SEQデータと結合し、48個のMIRNAを得た。MALAT1発現と正の相関がある遺伝子は528個であった。MIRTARBASEデータベースから上述の48個のMIRNAの標的遺伝子をスクリーニングし、正の関連遺伝子と交差し、323個の遺伝子を獲得した。48個のMIRNAと323個の遺伝子に基づいてMALAT1のCERNAネットワークを構築した。【結論】生物1によって仲介されるCERNA制御ネットワークは,バイオインフォマティクス法によって構築することができる。Data from the ScienceChina, LCAS.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  結合部位 ,  データベース ,  *RNA【核酸】 ,  *長鎖 ,  *ネットワーク ,  遺伝子
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  制御ネットワーク ,  標的遺伝子 ,  ハイスループット ,  生物情報 ,  *内因性 ,  *肺腺癌 ,  *非翻訳RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1 ,  Competing endogenous RNA ,  MicroRNA

分類 (6件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 長鎖非コードRNA ,  肺腺癌 ,  転写 ,  仲介 ,  内因性 ,  競合 ,  RNA ,  研究