植物マイクロRNAの進化:基本的真性双子葉植物ハスからの洞察【Powered by NICT】

Shi Tao; Wang Kun; Wang Kun; Yang Pingfang; Yang Pingfang

文献

J-GLOBAL ID：201702212019581208 整理番号：17A0749819

植物マイクロRNAの進化:基本的真性双子葉植物ハスからの洞察【Powered by NICT】

The evolution of plant microRNAs: insights from a basal eudicot sacred lotus

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資料名：
巻： 89 号： 3 ページ： 442-457 発行年： 2017年
JST資料番号： A1374A ISSN： 0960-7412 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

マイクロRNA(miRNA)は真核生物におけるmRNAを調節する重要な非コード小RNAである。しかし,どのような環境下で異なるmiRNA/miRNAファミリーは,植物における異なる進化軌跡を示した不明のままである。本研究では,著者らは,ハス(Nelumbo nuciferaあるいはハス),基底真正双子葉植物から低分子RNAおよびデグラドーム配列を決定しmiRNAとそれらの標的を同定した。公共miRNAを組み合わせて,筆者らは異なる進化段階から57前真性双子葉植物miRNAファミリーを予測した。高齢,高コピーと標的数を特徴とするmiRNAファミリーはmiRNAファミリー損失(PGL)と温帯および熱帯ハスの分岐中の純化淘汰の強い特徴のための低い傾向を示す傾向があることを見出した。ハスゲノムの更なる分析は,子孫植物及び重複ゲノムにおけるmiRNAファミリーの損失の間に関係があることを明らかにした。遺伝子量バランスは,強い純化淘汰を課すことによる優先的に保持されたMIRNA重複の維持に重要である。しかし,miRNAファミリーの進化に影響するこれらの因子と選択は推定MIRNA類には適用できない。ハス花粉-雌しべ相互作用に関与するMIRNAs,被子植物における保存された過程も純化淘汰の強い特徴を有している。機能,MIRNAs中の配列ダイバージェンスは,根茎と葉成長中の,温帯および熱帯ハスの間のそれらの標的遺伝子の発現多様性を増加した。全体として,著者らの研究は,植物と重複ゲノムにおけるmiRNAファミリー分布を決定し,MIRNA配列進化の機能的影響のための証拠を提供するいくつかの重要な因子と選択を明らかにした。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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遺伝子の構造と化学 , 遺伝子発現

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