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J-GLOBAL ID：201702219806062460   整理番号：17A0308673

キクのトランスクリプトームワイド同定と発現解析は転写因子をSBP様【Powered by NICT】

Transcriptome-wide identification and expression analysis of chrysanthemum SBP-like transcription factors

著者 (11件)： Song Aiping (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Song Aiping (Jiangsu Province Engineering Lab for Modern Facility Agriculture Technology & Equipment, Nanjing, 210095, China) ,  Gao Tianwei (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Wu Dan (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Xin Jingjing (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Chen Sumei (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Guan Zhiyong (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Wang Haibin (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Jin Lili (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Chen Fadi (College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, 210095, China) ,  Chen Fadi (Jiangsu Province Engineering Lab for Modern Facility Agriculture Technology & Equipment, Nanjing, 210095, China)
資料名： Plant Physiology and Biochemistry  (Plant Physiology and Biochemistry)
巻： 102  ページ： 10-16  発行年： 2016年05月 
JST資料番号： W1643A  ISSN： 0981-9428  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： フランス (FRA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SQUAMOSAプロモーター結合蛋白質(SBP)転写因子は,植物における多くの過程で機能することが知られている。ここでは,重要な観賞種キク(Chrysanthemum morifolium)における十二SBP様(SPL)遺伝子を特性化した。の十二種類の配列はトランスクリプトーム配列に基づく分離し,増幅した。系統解析はArabidopsisとキクの二対のオーソロガス蛋白質とキクのパラロガス蛋白質の二対を同定した。Arabidopsisおよびキクにより共有されるSPL蛋白質における保存されたモチーフはMEMEを用いてスキャンした。バイオインフォマティクス解析は,これらの遺伝子の六はmiR156標的部位を含むことを明らかにしたが,五CmSPLsはmiR157による標的とされた。さらに,5′RLM-RACEを用いCmSPL2とCmSPL3における切断部位を地図化した。植物ホルモン処理と非生物的ストレスに応答してこれら十二種類の遺伝子の発現を特性化した。本研究は,ストレス応答におけるSPL遺伝子ファミリーメンバーの多様な機能の理解を改善する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  Arabidopsis ,  キャラクタリゼーション ,  プロモーター領域 ,  植物ホルモン ,  *トランスクリプトーム ,  キク属 ,  タンパク質
準シソーラス用語： 遺伝子ファミリー ,  ストレス応答 ,  非生物的ストレス ,  バイオインフォマティクス ,  オルソログ蛋白質 ,  系統解析 ,  *遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Chrysanthemum morifolium ,  系統発生解析 ,  SBPボックス ,  ストレス応答 ,  転写パターン

分類 (1件)： 植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： キク ,  トランスクリプトーム ,  同定 ,  発現解析 ,  転写因子