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J-GLOBAL ID：201702224411201952   整理番号：17A0323570

高悪性度漿液性卵巣癌と予後におけるmiRNA-mRNA相互作用のモジュール性とダイナミシティ【Powered by NICT】

The modularity and dynamicity of miRNA-mRNA interactions in high-grade serous ovarian carcinomas and the prognostic implication

著者 (5件)： Zhang Wensheng (Department of Computer Science, Xavier University of Louisiana, 1 Drexel Drive, New Orleans, LA 70125, United States) ,  Edwards Andrea (Department of Computer Science, Xavier University of Louisiana, 1 Drexel Drive, New Orleans, LA 70125, United States) ,  Fan Wei (Big Data Lab, Baidu Research, 1195 Bordeaux Dr., Sunnyvale, CA 94089, United States) ,  Flemington Erik K. (Tulane Health Sciences Center, Tulane Cancer Center, Tulane University, 1700 Tulane Ave, New Orleans, LA 70112, United States) ,  Zhang Kun (Department of Computer Science, Xavier University of Louisiana, 1 Drexel Drive, New Orleans, LA 70125, United States)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 63  ページ： 3-14  発行年： 2016年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 卵巣癌は米国の女性における癌死の第五の主要原因である。この持続性死亡率の主な理由は,根底にある生物学の貧弱な理解と信頼できるバイオマーカーの欠如を含んでいた。以前の研究は,異常に発現したマイクロRNA(miRNA)は遺伝子発現を翻訳後に調節することによる発癌と腫瘍進行に関与していることを示した。しかし,腫瘍形成におけるmiRNAの干渉は全く複雑であり,十分に理解されているものから程遠いものである。本研究では,mRNA発現の統合的解析により,miRNA発現および臨床データは公表された癌ゲノムアトラス(TCGA),miRNA-mRNA相互作用のモジュール性と動的変化および高悪性度漿液性卵巣癌における予後的意義を検討した。入力としてトップ転写相関(Bonferroni補正後のp値<0.01)を用いて,五miRNA-mRNAモジュール対(MP)し,それぞれは1つの正の関連(相関)モジュールと一つの負結合(相関)モジュールを同定した。各モジュールにおけるmiRNAまたはmRNAの数は3~7または2~873であった。四主要な負の接続モジュールの中で,三は広く受け入れられているmiRNA仲介転写後調節理論と良く一致した。これらのモジュールは,細胞周期と免疫応答に関連する遺伝子に富んでいた。基を明らかにしたあるいはこれら二RNAクラス間の特異的動的規制をサンプリングするために二つの新しいアルゴリズムを提案した。得られたmiRNA-mRNA動的ネットワークは様々な癌進行段階または腫瘍グレードを横切る3350相互作用を含んでいる。はこれらの動的相互作用はいくつかのmiRNAに集中する傾向が認められ(例えばmiRNA,936),と発見されたモジュール外miRNA mRNA対に存在する可能性が高かった。添加では,56モジュール蛋白質コード遺伝子の強力な予後署名から成る,共発現パターンは複数の独立したコホートにおける卵巣癌患者の生存期間の予測を正確に指摘した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 発癌 ,  母集団 ,  *RNA【核酸】 ,  *mRNA ,  細胞周期 ,  女性 ,  患者 ,  バイオマーカー ,  *卵巣腫瘍 ,  死亡率
準シソーラス用語： 共発現 ,  転写後調節 ,  mRNA発現 ,  腫瘍進行 ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 卵巣癌 ,  m RNA ,  miRNA ,  ネットワーク ,  モジュール ,  動的相互作用 ,  予後シグネチャ

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 悪性度 ,  漿液性卵巣癌 ,  予後 ,  miRNA ,  mRNA ,  相互作用