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J-GLOBAL ID：201702225022937939   整理番号：17A0162991

ウシ乳房炎連鎖球菌GAPC蛋白質のバイオインフォマティクス解析と組換えエピトープワクチン設計【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis of cow mastitis Streptococcus GapC protein and designing of recombinant epitope vaccine

著者 (8件)： Kong Zhixiang (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology) ,  Liu Xiang (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology) ,  Ou Shasha (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology) ,  Liu Chengyan (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology) ,  Tong Hanhu (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology) ,  Chen Chunlin (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology) ,  Chen Chen (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology) ,  Wu Sanqiao (Chinese-German Joint Institute for Natural Product Research /Shaanxi University of Technology)
資料名： Jiangsu Daxue Xuebao  (Jiangsu Daxue Xuebao)
巻： 32  号： 4  ページ： 824-831  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2703A  ISSN： 1000-4440  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ウシ乳房炎連鎖球菌(GAPC)のGAPC蛋白質のエピトープを設計し,GAPCの免疫効果を改善するために,DNAMANとMEGAソフトウェアを用いてGAPCの相同性と系統発生を分析した結果,異なる種の連鎖球菌の近縁関係が近いことが示された。特に乳牛の乳房炎に関連する連鎖球菌の近縁関係はより近い。オンラインソフトウェアを用いて,GAPCは親水性蛋白質であり,いくつかの酵素部位が存在することが予測された。SIGNALP4.1とTMHMM SERVER V.2.0ソフトウェアを用いて、GAPCのシグナルペプチドと膜貫通構造を予測し、細胞表面に定位した。SOPMAは,GAPCの二次構造において,ランダムコイル,Α-ヘリックス,Β-ターン,およびΒ-シートの含有量を予測した。SWISS-MODELによって予測したGAPCの二次構造は二次構造と一致した。ABCPREDとBEPIPREDスキームを用いて,GAPCには5つのB細胞エピトープが存在することが予測された。神経回路網と量子化マトリックス法を用いて,GAPCが1つのCTLエピトープを持つことを予測した。MHC-II分子結合ペプチドオンライン予測プログラムを用いて,GAPCが1つのTHエピトープを持つことを予測した。DNASTAR PROTEANソフトウェアを用いて組換えGAPCエピトープを再構築し、抗原性の良いGAPC組換えペプチドを設計した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 免疫原性 ,  ソフトウェア ,  *連鎖球菌属 ,  二次構造 ,  相同性 ,  有限要素法 ,  系統発生 ,  再構成 ,  シグナルペプチド ,  *エピトープ ,  神経回路網 ,  親水性 ,  *ウシ乳房炎
準シソーラス用語： 細胞表面 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： cow mastitis ,  Streptococcus spp. ,  GapC protein ,  protein structure ,  cell epitope

分類 (3件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： ウシ乳房炎 ,  連鎖球菌 ,  バイオインフォマティクス解析 ,  組換え ,  エピトープ ,  ワクチン ,  設計