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J-GLOBAL ID：201702226306590140   整理番号：17A0278063

系統樹を構築するためのクラスタリングと距離評価を用いたアラインメントに基づく方法【Powered by NICT】

Alignment based method using clustering and distance evaluation for construction of phylogenetic tree

著者 (2件)： Kaur Manmeet (CSE dept., ACET, Amritsar College of Engineering and Technology, Amritsar, India) ,  Bawa Navneet Kaur (CSE dept., ACET, Amritsar College of Engineering and Technology, Amritsar, India)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： InCITe  ページ： 224-229  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： プロテオミクスの分野でますますデータの追加のために,計算方法は非常に効率的であることが必要である。分子配列の最も耐性の一部である分子に機能的により重要である。種々のアライメント技術を解析し,配列アラインメントの信頼性を確保した。提案した研究では多重配列アラインメントは,進化の歴史の一部である使用されている。MSAは個々の配列位置間の相同対応を見出すことにより複数の配列を整列させた。様々なMedicago sativa品種はNCBIデータバンクからの負荷した。これらの配列に基づいて,データセットの分割部品の,系統樹を構築した。進歩枝刈り技法を用いて,以前に生成された木から形成される単木。しきい値条件を適用することにより,密接に関連した配列が得られた。最適配列に対してアラインメントシフト演算は両方向に適用した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： データベース ,  *アラインメント ,  信頼性 ,  プロテオミクス ,  アルファルファ ,  演算 ,  品種 ,  *系統樹
準シソーラス用語： NCBI ,  配列アライメント ,  分子配列 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 系統樹 ,  構築 ,  クラスタリング ,  評価 ,  アラインメント