文献

J-GLOBAL ID：201702228975560610   整理番号：17A0219219

分子軌道法で実証した水の分子動力学シミュレーションにおける三体相互作用の重要性

Importance of Three-Body Interactions in Molecular Dynamics Simulations of Water Demonstrated with the Fragment Molecular Orbital Method

著者 (9件)： PRUITT Spencer R. (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  NAKATA Hiroya (Kyocera Corp., Kagoshima, JPN) ,  NAGATA Takeshi (National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol., Ibaraki, JPN) ,  MAYES Maricris (Univ. Massachusetts Dartmouth, Massachusetts, USA) ,  ALEXEEV Yuri (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  FLETCHER Graham (Argonne National Lab., Illinois, USA) ,  FEDOROV Dmitri G. (National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol., Ibaraki, JPN) ,  KITAURA Kazuo (Kobe Univ., Kobe, JPN) ,  GORDON Mark S. (Iowa State Univ., Iowa, USA)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 12  号： 4  ページ： 1423-1435  発行年： 2016年04月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本稿で与えた研究は,特に室温での分子動力学シミュレーションにおいて,フラグメント分子軌道法(FMO)法を用いて水性系をシミュレートする際の三体相互作用の必要性を実証した。原子座標に関する解析的な一次導関数を,三体FMOの枠組みの中で定式化し,実装した。この勾配を,限定された二次Moeller-Plesset摂動論,ならびに制限および非制限Hartree-Fockおよび密度汎関数理論の両者に対して導出し,実装した。三体の完全に解析な勾配の重要性を,小さな水クラスタの分子動力学シミュレーション中の二体FMO法の失敗によって説明した。フラグメント分子軌道法の並列実装,その並列効率,最大262144のCPUコアのBlue Gene/Qアーキテクチャでのスケーラビリティについても説明した。

シソーラス用語： *水 ,  *分子軌道法 ,  *計算機シミュレーション ,  *相互作用 ,  座標 ,  MP2法 ,  導関数 ,  Hartree-Fock法 ,  密度汎関数法 ,  クラスタ分子 ,  並列演算 ,  実装 ,  スーパコンピュータ
準シソーラス用語： *分子動力学シミュレーション ,  *三体相互作用 ,  原子座標 ,  水クラスター ,  並列実装 ,  *フラグメント分子軌道法

分類 (1件)： 溶液論一般  (CB05010Z)

タイトルに関連する用語 (6件)： 分子軌道法 ,  実証 ,  水 ,  分子動力学シミュレーション ,  三体相互作用 ,  重要性