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J-GLOBAL ID:201702230087841913   整理番号:17A0070788

ヒトサイトメガロウイルス無症候性感染者UL144遺伝子多型の研究【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Polymorphisms in the HCMV UL144Gene in Clinical Isolates from Children with Asymptomatic Infection
著者 (8件):
資料名:
巻: 32  号:ページ: 610-618  発行年: 2016年 
JST資料番号: C2388A  ISSN: 1000-8721  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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ヒトのサイトメガロウイルス(HCMV)無症候性感染者のUL144遺伝子多型を調査するために,ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を用いて,UCMV144遺伝子のオープンリーディングフレーム(ORF)を増幅した。生物情報学ツールBioEdit,DNAstar,Mega5.0,GeneDocなどのソフトウェアにより配列特徴分析を行った。結果により、50例のHCMV-DNA陽性無症候性感染者の尿沈渣標本において、21例の標本のUL144遺伝子は陽性で、陽性率は42%であり、そしてシークエンシングを完成した。相同性比較は,ヌクレオチド相同性が80.2%~100%,アミノ酸相同性が77.8%~100%であることを示した。系統樹分析により、21例の無症候性感染者のDNA配列は主に2つの遺伝子型に分けられ、A型(10例、47.61%)とB型(11例、52.38%)で、その他の遺伝子型は見られなかった。結果は,UL144遺伝子のコード化生成物の重要な官能基を予測し,ASN,PKC,TNFR,NCD3Gなどの翻訳後修飾部位が高度に保存されていることを示した。UL144A型と比較して,UL144B型は1-16と30-96アミノ酸残基の間にPROKAR_LIPOPROTEIN部位とZF_CTCHY部位を増加させた。Toledo標準ウイルス株と比較すると、UL144A型のCRD1とCRD2領域は高度に保存されており、UL144BのCRD1とCRD2機能区の変異は比較的大きい。しかし、膜貫通領域(transmembraneのdomain)と細胞質領域(cytoplasmicdomain)はUL144A型とB型型において高度に保存されている。UL144A型とB型塩基変異はUL144蛋白質の予測などの電気点と二次構造に大きな変化をもたらさなかった。つまりHCMV感染症者と異なり、HCMV無症候性感染者UL144遺伝子型はA型とB型である。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】
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遺伝子の構造と化学  ,  遺伝子発現 
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