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J-GLOBAL ID：201702231689010519   整理番号：17A0068908

広東地区におけるインフルエンザA型インフルエンザウイルスのHA遺伝子変異と進化による抗原エピトープへの影響【JST・京大機械翻訳】

Effect of evolution and mutations of H3N2 virus hemagglutinin genes on the antigenic epitopes in Guangdong

著者 (7件)： Yu Liang (Key Laboratory for Emergency Pathogen Detection,Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Zhang Xin (Key Laboratory for Emergency Pathogen Detection,Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Huang Ping (Key Laboratory for Emergency Pathogen Detection,Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Liang Lijun (Key Laboratory for Emergency Pathogen Detection,Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Zhong Jing (广州市胸科医院伝染科) ,  Zeng Xianqiao (Key Laboratory for Emergency Pathogen Detection,Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Ni Hanzhong (Key Laboratory for Emergency Pathogen Detection,Guangdong Provincial Center for Disease Control and Prevention)
資料名： Zhonghua Chuanranbing Zazhi  (Zhonghua Chuanranbing Zazhi)
巻： 34  号： 7  ページ： 404-409  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2333A  ISSN： 1000-6680  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:2014年から2015年までの広東省におけるインフルエンザウイルス(H1N1)のH3N2ウイルス(HA)遺伝子の進化特性とエピトープの変異を調査すること。方法:時空間サンプリング法を用い、2014~2015年の広東省から分離した17株のインフルエンザH3N2ウイルスのHA遺伝子のヌクレオチド配列を測定し、GENBANKの36株の参考遺伝子配列をダウンロードした。HA遺伝子のヌクレオチド配列を比較し、遺伝子アミノ酸の変異を分析し、遺伝進化ツリーとShang値図を構築した。同時に,2014-2015年の広東省におけるHA遺伝子のエピトープ変異と選択性を分析した。結果:ワクチン株A/TEXAS/A/TEXAS/株のHA遺伝子を基準とし、2014~2015年の広東地区の17株のインフルエンザ菌株HA遺伝子には25個のアミノ酸置換があった。HA1遺伝子エピトープA、B、DとEは変異し、11個のアミノ酸部位に係る。菌株A/GUANGDONG/A/GUANGDONG/のHA遺伝子はN38K変異を示し,1つのグリコシル化部位を減少させた。鋭いの変位点は175ビット(エントロピー値は1.16)であった。単一尤度祖先数(SLAC)、固定効果尤度比(FEL)と内部固定効果尤度比(IFEL)モデルのスクリーニング結果を総合的に評価すると、正方向選択部位は位位を含み、負選択部位は位と425を含む。結論:広東省のインフルエンザウイルスH3N2ウイルスのHA遺伝子エピトープA、B、DとEは変異が発生し、進化の正の選択部位には位が含まれ、負の選択サイトには位と425が含まれる。突然変異はインフルエンザA3N2ウイルスの流行を引き起こす可能性がある。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  突然変異 ,  グリコシル化 ,  アミノ酸 ,  *インフルエンザウイルス ,  *遺伝 ,  *ウイルス ,  *インフルエンザ ,  スクリーニング ,  ヌクレオチド配列 ,  *エピトープ
準シソーラス用語： アミノ酸置換 ,  遺伝子配列 ,  *HA遺伝子 ,  広東省 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： H3N2 strains ,  Hemagglutinins ,  Mutation ,  Evolution ,  Epitopes

分類 (2件)： 産業経済  (KA02000Y) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (8件)： 地区 ,  インフルエンザ ,  A型インフルエンザウイルス ,  HA遺伝子 ,  変異 ,  進化 ,  抗原 ,  エピトープ