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J-GLOBAL ID：201702233608120774   整理番号：17A0700290

Plutella xylostellaマイクロRNAとそれらのゲノムワイド標的同定の改訂された注釈【Powered by NICT】

Revised annotation of Plutella xylostella microRNAs and their genome-wide target identification

著者 (2件)： Etebari K. (School of Biological Sciences, The University of Queensland, Brisbane, QLD, Australia) ,  Asgari S. (School of Biological Sciences, The University of Queensland, Brisbane, QLD, Australia)
資料名： Insect Molecular Biology  (Insect Molecular Biology)
巻： 25  号： 6  ページ： 788-799  発行年： 2016年 
JST資料番号： W1733A  ISSN： 0962-1075  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コナガ,Plutella xylostella(コナガ)は,世界的にアブラナ属作物の最も破壊的な害虫である。128成熟マイクロRNA(miRNA)はmiRBaseにおけるこの種から注釈されてきたが,最近改良されたゲノムアセンブリーの結果として電流P.xylostella miRNAレパートリーを拡張し,補正する必要性とより多くの利用可能な低分子RNA配列データである。著者らの新しい超深度配列データ及び生物情報科学を用いて正確な5pと3p腕特徴と高い信頼性miRNAのP.xylostellaゲノムの再注釈する。さらに,全てのP.xylostellaの注釈付き遺伝子も三種の標的予測アルゴリズムを用いた潜在的miRNA結合部位を同定するためにスクリーニングした。全体で,203の成熟miRNAが注釈され,33の新規miRNAsを含んでいた。160pxy miRNAの7691高度に確信的な結合部位を同定した。この破壊的害虫の持続可能な管理のための新しいアプローチを導入するプラットフォームとしてここで提供されたデータは,P.xylostella miRNAの機能的分析を含む将来の研究を容易にするであろう。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *ゲノム ,  農作物 ,  結合部位 ,  *コナガ ,  *アノテーション ,  害虫 ,  機能分析 ,  信頼性 ,  アブラナ属 ,  電流
準シソーラス用語： 予測アルゴリズム ,  バイオインフォマティクス ,  低分子RNA ,  ゲノムアセンブリ ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Plutella xylostella ,  マイクロRNA ,  標的 ,  コナガ

分類 (2件)： 昆虫・ダニによる植物被害  (FC04072U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： Plutella ,  マイクロRNA ,  ゲノム ,  標的 ,  同定 ,  改訂 ,  注釈