文献

J-GLOBAL ID：201702233803012557   整理番号：17A0317217

単細胞トランスクリプトミクスによる網膜双極ニューロンの包括的分類【Powered by NICT】

Comprehensive Classification of Retinal Bipolar Neurons by Single-Cell Transcriptomics

著者 (28件)： Shekhar Karthik (Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Lapan Sylvain W. (Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Lapan Sylvain W. (Howard Hughes Medical Institute, Chevy Chase, MD 20815, USA) ,  Whitney Irene E. (Center for Brain Science and Department of Molecular and Cellular Biology, Harvard University, Cambridge, MA 02130, USA) ,  Tran Nicholas M. (Center for Brain Science and Department of Molecular and Cellular Biology, Harvard University, Cambridge, MA 02130, USA) ,  Macosko Evan Z. (Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Macosko Evan Z. (Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Macosko Evan Z. (Program in Medical and Population Genetics, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Kowalczyk Monika (Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Adiconis Xian (Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Adiconis Xian (Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Levin Joshua Z. (Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Levin Joshua Z. (Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Nemesh James (Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Nemesh James (Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Nemesh James (Program in Medical and Population Genetics, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Goldman Melissa (Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Goldman Melissa (Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  McCarroll Steven A. (Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  McCarroll Steven A. (Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  McCarroll Steven A. (Program in Medical and Population Genetics, Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Cepko Constance L. (Department of Genetics, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Cepko Constance L. (Department of Ophthalmology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Cepko Constance L. (Howard Hughes Medical Institute, Chevy Chase, MD 20815, USA) ,  Regev Aviv (Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, MA 02142, USA) ,  Regev Aviv (Howard Hughes Medical Institute, Chevy Chase, MD 20815, USA) ,  Regev Aviv (Department of Biology and Koch Institute, MIT, Cambridge, MA 02139, USA) ,  Sanes Joshua R. (Center for Brain Science and Department of Molecular and Cellular Biology, Harvard University, Cambridge, MA 02130, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 166  号： 5  ページ： 1308-1323.e30  発行年： 2016年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現のパターンは,ニューロン型を特性化し,分類するために用いることができる。しかし,挑戦的である包括的であり,従来の分類方式と調和の本質的な基準を満たすと,真のタイプの過剰な区画を欠くことを分類を生成した。これらの課題に対処するために,著者らはニューロンの不均一なクラスに超並列単細胞RNAプロファイリングと最適化計算法を用いたマウス網膜双極細胞(BC)。~25,000BCの個体群から,著者らは,以前に観察された全てのタイプと二の新規タイプを含む,そのうちの1つは非標準的形態と位置を持つ15種類を同定した分子分類を導いた。分類スキームを検証し,細胞形態への分子発現と一致する法を用いて多数の新規マーカーを同定した。ニューロンの包括的な分子分類を達成するための系統的な方法論を提供し,新しいニューロン型を同定し,クラス内のタイプを識別する転写の相違を明らかにした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  最適化 ,  *網膜 ,  超並列処理 ,  *ニューロン ,  RNA【核酸】 ,  個体群 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： 細胞形態 ,  網膜双極細胞 ,  プロファイリング ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 中枢神経系  (EJ12030F)

タイトルに関連する用語 (4件)： 単細胞 ,  トランスクリプトミクス ,  網膜 ,  分類