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J-GLOBAL ID：201702234185930413   整理番号：17A0109461

全ゲノム配列アラインメントに基づく大腸菌ファージ感染能力分析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of the Infection Capacity of Coliphage based on Whole Genome Sequence Alignment

著者 (8件)： Nie Li (Key Laboratory of the Conservation and Sustainable Utilization for Subtropical Plant Resources of Jiangxi Province, Jiangxi Normal University) ,  Ma Yangshuai (Key Laboratory of the Conservation and Sustainable Utilization for Subtropical Plant Resources of Jiangxi Province, Jiangxi Normal University) ,  Zhong Junhua (Jiangxi Industry Polytechnic College) ,  Yang Huilin (Key Laboratory of the Conservation and Sustainable Utilization for Subtropical Plant Resources of Jiangxi Province, Jiangxi Normal University) ,  Wang Xiaolan (Key Laboratory of the Conservation and Sustainable Utilization for Subtropical Plant Resources of Jiangxi Province, Jiangxi Normal University) ,  Chen Liqiong (Key Laboratory of the Conservation and Sustainable Utilization for Subtropical Plant Resources of Jiangxi Province, Jiangxi Normal University) ,  Wang Guangyao (Key Laboratory of the Conservation and Sustainable Utilization for Subtropical Plant Resources of Jiangxi Province, Jiangxi Normal University) ,  Zhao Yue (Key Laboratory of the Conservation and Sustainable Utilization for Subtropical Plant Resources of Jiangxi Province, Jiangxi Normal University)
資料名： Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue  (Jiyinzuxue Yuyingyong Shengwu Xue)
巻： 35  号： 8  ページ： 2045-2054  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2933A  ISSN： 1674-568X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： これまで,NCBIゲノムデータベースにおいて大腸菌とそのファージの全ゲノム配列数が多く,これらの大きなデータは全ゲノム配列アラインメントに基づいて大腸菌ファージの感染能力と宿主の抗感染能力を研究するのに十分である。現在、大腸菌ファージの感染能力に関する報告は見られない。本研究はファージの感染能力とその特異性を研究するためにデータを提供する。NCBIデータベースから大腸菌の進化樹上の代表株とすべての大腸菌ファージ遺伝子配列をダウンロードし、BLASTソフトを用いて配列比較を行い、ファージと宿主の1対1の対応関係を発見した。また、Rなどの関連ソフトウェアを用いて、ファージの異なる大腸菌宿主に対する感染能力を分析した。35の大腸菌ファージの中で,ESCHERICHIA PHAGE HK75の4つのファージは最も強い感染能力を示した。ESCHERICHIA PHAGE PHAX IとESCHERICHIA PHAGE VB_ECOM_CBA120の感染能力は弱かった。44の大腸菌株の中で,ESCHERICHIA COLI STRAIN400791,ESCHERICHIA COLI M605の感受性は高かった。ESCHERICHIA COLI MS84-1の抗ファージ能力は強かった。本研究では、全ゲノム配列比較法を用いて、ファージの宿主への感染能力を分析し、ファージの感染能力の研究に参考データを提供する。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *感染 ,  *性能分析 ,  *大腸菌 ,  *ゲノム ,  データベース ,  *バクテリオファージ
準シソーラス用語： 比較法 ,  BLAST ,  遺伝子配列 ,  特異性 ,  *ゲノム配列 ,  ゲノムデータベース ,  NCBI ,  *大腸菌ファージ ,  *配列アライメント , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Escherichia coli ,  Phage ,  Infection capacity ,  Whole genome sequence alignment

分類 (6件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  食品の汚染  (FJ01053P) ,  水質汚濁一般  (SB02010U) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  ウイルス学一般  (EG04010J) ,  ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： ゲノム ,  配列アラインメント ,  大腸菌ファージ ,  感染 ,  能力分析