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J-GLOBAL ID：201702234611846493   整理番号：17A0598669

CYP3A4における末梢部位への配位子結合の数値計算解析 配座動力学および阻害剤発見

Computational Investigation of Ligand Binding to the Peripheral Site in CYP3A4: Conformational Dynamics and Inhibitor Discovery

著者 (7件)： DU Hanwen (East China Univ. Sci. and Technol., Shanghai, CHN) ,  LI Junhao (East China Univ. Sci. and Technol., Shanghai, CHN) ,  CAI Yingchun (East China Univ. Sci. and Technol., Shanghai, CHN) ,  ZHANG Hongxiao (East China Univ. Sci. and Technol., Shanghai, CHN) ,  LIU Guixia (East China Univ. Sci. and Technol., Shanghai, CHN) ,  TANG Yun (East China Univ. Sci. and Technol., Shanghai, CHN) ,  LI Weihua (East China Univ. Sci. and Technol., Shanghai, CHN)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 57  号： 3  ページ： 616-626  発行年： 2017年03月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： CYP3A4は薬物代謝酵素であり,多くの配位子に対し結合および動力学挙動を示す。本研究では,分子ドッキング,分子動力学(MD)シミュレーション,バーチャルスクリーニングおよびバイオアッセイの組み合わせを用いて,末梢部位へ結合された配位子の安定性および新しいCYP3A4配位子の発見を調べた。結晶構造におけるCYP3A4の基質,プロゲステロン(PGS)の結合モードは不安定であり,配座変化を受けることを結果が明らかにした。PGSは,アミノ酸との接触を通じて末梢部位において安定に結合できることをガイドドッキングおよびMD精密化を通じて見出した。

シソーラス用語： *チトクロームP450 ,  *配位子 ,  *数値解析 ,  *立体配座 ,  *動力学 ,  *酵素阻害剤 ,  薬物代謝酵素 ,  ドッキング ,  分子認識 ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  スクリーニング ,  バーチャルリアリティ ,  バイオアッセイ ,  安定性 ,  結晶構造 ,  基質 ,  黄体ホルモン ,  配座転移 ,  アミノ酸 ,  精密化 ,  ステロイド ,  ステロイドホルモン ,  エノン ,  脂環式ケトン ,  ジケトン
準シソーラス用語： *CYP3A4 ,  *数値計算解析 ,  *配座 ,  分子ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  バーチャルスクリーニング ,  配座変化

分類 (3件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  数値解析,近似法  (AB04000F)

物質索引 (1件)： プロゲステロン

タイトルに関連する用語 (7件)： CYP3A4 ,  配位子 ,  数値計算解析 ,  配座 ,  動力学 ,  阻害剤 ,  発見