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J-GLOBAL ID：201702235085989657   整理番号：17A0527560

胆道閉鎖循環MIRNAのハイスループット配列解析【JST・京大機械翻訳】

High-throughput sequencing of circulating miRNAs in patients with biliary atresia

著者 (10件)： Peng Xiao fang (Clinical Laboratory, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Fu Jie (Birth Cohort Study, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Wen Zhe (Neonatal Surgery Department, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Pang Shuyin (Clinical Laboratory, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Chen Yihao (Clinical Laboratory, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Gao Kankan (Clinical Laboratory, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Gu Shaoling (Clinical Laboratory, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Yang Liyuan (Clinical Laboratory, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Chen Zhengrong (Pathology Department, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University) ,  Liu Haiying (Clinical Laboratory, Guangzhou Women & Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University)
資料名： Zhonghua Xiaoerwaike Zazhi  (Zhonghua Xiaoerwaike Zazhi)
巻： 37  号： 11  ページ： 815-822  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2312A  ISSN： 0253-3006  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】胆道閉鎖症(BA)患者の末梢血における循環miRNAの発現特性を分析するために,高スループット二次配列決定法を用いた。新しい疾患関連非侵襲性診断マーカーを探すために根拠を提供する。【方法】2013年1月から2014年5月までに,著者らの病院において29人のBA患者を集めた。10例の乳児肝炎症候群、5例のCitrin遺伝子欠損による新生児肝内胆汁うっ滞症(NICCD)、5例の総胆管嚢腫(疾病対照群)と29例の健康対照(正常対照群)の血漿サンプル。早期収集した疾病群と正常対照群の各9例をハイスループットシークエンシングに用い、両群児童をそれぞれ性別と年齢のマッチングにより3群に分け、血漿サンプルを上述のグループに分けてグループ内などの割合で混合し、血漿混合池の総RNAを抽出した。混合試料中の全miRNA配列をIlluminaHiSeq20により分析した。t検定,標的遺伝子予測ソフトウェアTargetScan,miRandaおよびPITAを用いて,差次的miRNAの機能を予測した。リアルタイム蛍光定量的ポリメラーゼ連鎖反応(reversetranscriptionquantitative)により,特異的に発現するmiRNAの発現について検証した。結果:本研究では、BA患児の循環miRNA発現プロファイルを構築することに成功した。BA患児群と正常対照群の間に188個の循環miRNA発現に差があり(P<0.05)、87個のアップレギュレーション、101個のダウンレギュレーション、56個が新たに発見されたmiRNAで、残りはすべてデータベース中の既知miRNAである。発現差が2倍以上のmiRNAは146個,77個は上方制御,69個は下方制御された。その中で、発現量が高く、各サンプル群で恒常的に発現するmiRNAは8つあり、いずれも既知miRNAであり、上方制御されたhas-miR-122-5p、-100-5p、-432-5pを含んでいる。ダウンレギュレーションしたhas-miR-140-3p,-10b-5p,-26a-5p,-126-3p,-74-5p;機能予測により、この8つの差異miRNAは肝胆のう発育、肝繊維化、細胞アポトーシスなどと関係があることが示された。RT-qPCRの結果は,BA群におけるhsa-miR-122-5p,-100-5pの発現が正常対照群におけるそれより有意に高いことを示した。しかし,hsa-miR-140-3p,-10b-5p,-126-3pは,正常対照群のそれらより有意に低かった(P<0.05)。結論:本研究の結果はBA患児の末梢血循環におけるmiRNAの発現特徴を全面的に示し、その中のいくつかの差異性のmiRNAはBAの非侵襲性診断の候補マーカーとなる可能性がある。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 新生児 ,  アポトーシス ,  蛍光 ,  血漿 ,  アップレギュレーション ,  PCR法 ,  乳児 ,  ダウンレギュレーション ,  患者 ,  *胆道閉鎖 ,  データベース ,  末梢血
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  対照群 ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Biliary atresia ,  MicroRNAs ,  High throughput sequencing ,  Markers ,  DNA

分類 (2件)： 先天性疾患・奇形一般  (GD03010V) ,  代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： 胆道閉鎖 ,  循環miRNA ,  ハイスループット ,  配列解析