文献

J-GLOBAL ID：201702238431765757   整理番号：17A0417560

次世代配列決定のための14.8A,135mW完全集積データプロセッサ【Powered by NICT】

14.8 A 135mW fully integrated data processor for next-generation sequencing

著者 (3件)： Wu Yi-Chung (National Taiwan University, Taipei, Taiwan) ,  Hung Jui-Hung (National Chiao Tung University, Hsinchu, Taiwan) ,  Yang Chia-Hsiang (National Taiwan University, Taipei, Taiwan)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2017  号： ISSCC  ページ： 252-253  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNA配列決定はDNA分子内のヌクレオチドの正確なため(A, C, G, T)を決定するプロセスであり,遺伝学および医学研究に不可欠である。短DNAフラグメントが大規模平行様式で配列決定することができ,次世代シークエンシング(NGS)は,ハイスループット配列決定[1]を可能にした。しかし,DNAマッピングとして知られている,後続データ解析が過度に時間がかかる。DNAマッピングは接尾辞アレイ(SA)ソーティングと後方探索に分割できる。速度,あまり複雑ではない後方探索[2]に対してのみを強化するために提案した専用ハードウェア設計。SA選別,最も複雑な部分のための実行可能なハードウェアは検討されていない。SA選別と後方探索を実現する完全に統合されたNGSデータプロセッサを紹介した。分散ソートアルゴリズムを用いてソーティングの複雑さを低減した。SAソーティングのスループットは2,048挿入ソーティングエレメントを介して最大化した。専用オーバフローとスプリッタキャッシュは計算の待ち時間を減らすために埋め込まれている。最適化されたハードウェアアーキテクチャにより,NGSプロセッサは,高性能汎用プロセッサと比較してエネルギーおよびスループット計量の一桁の改善を達成した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 最適化 ,  ソーティング ,  スループット ,  *データ処理装置 ,  遺伝学 ,  オーバフロー ,  *演算プロセッサ ,  待ち時間 ,  データ解析 ,  DNA【核酸】 ,  ハードウェア
準シソーラス用語： ハイスループット ,  次世代シークエンシング ,  DNAフラグメント ,  DNA配列 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 次世代 ,  集積 ,  データプロセッサ