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J-GLOBAL ID：201702244041408392   整理番号：17A0324348

変換できるEscherichia coliにおけるプロテオミクスツールによる評価されるアセチラーゼを担うpMdT1プラスミドの機構【Powered by NICT】

Could transformation mechanisms of acetylase-harboring pMdT1 plasmid be evaluated through proteomic tools in Escherichia coli?

著者 (24件)： Magalhaes Pedro (Functional Genomics and Proteomics Unit, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Magalhaes Pedro (Department of Genetics and Biotechnology, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Pinto Luis (Functional Genomics and Proteomics Unit, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Pinto Luis (Department of Genetics and Biotechnology, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Goncalves Alexandre (Functional Genomics and Proteomics Unit, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Goncalves Alexandre (Department of Genetics and Biotechnology, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Araujo Jose Eduardo (UCIBIO-REQUIMTE, Faculty of Science and Technology, University NOVA of Lisbon, Caparica, Portugal) ,  Santos Hugo M. (UCIBIO-REQUIMTE, Faculty of Science and Technology, University NOVA of Lisbon, Caparica, Portugal) ,  Santos Hugo M. (ProteoMass Scientific Society, Faculty of Sciences and Technology, Caparica, Portugal) ,  Capelo Jose Luis (UCIBIO-REQUIMTE, Faculty of Science and Technology, University NOVA of Lisbon, Caparica, Portugal) ,  Capelo Jose Luis (ProteoMass Scientific Society, Faculty of Sciences and Technology, Caparica, Portugal) ,  Saenz Yolanda (Area de Microbiologia Molecular, Centro de Investigacion Biomedica de La Rioja (CIBIR), Logrono, Spain) ,  de Toro Maria (Area de Microbiologia Molecular, Centro de Investigacion Biomedica de La Rioja (CIBIR), Logrono, Spain) ,  de Toro Maria (Instituto de Biomedicina y Biotecnologia de Cantabria IBBTEC, Universidad de Cantabria/CSIC, Santander, Spain) ,  Torres Carmen (Area de Microbiologia Molecular, Centro de Investigacion Biomedica de La Rioja (CIBIR), Logrono, Spain) ,  Torres Carmen (Department of Food and Agriculture, Biochemistry and Molecular Biology, University of La Rioja, Logrono, Spain) ,  Chambon Christophe (Institut National de la Recherche Agronomique, Centre Auvergne-Rhone-Alpes, Plate-Forme d’Exploration du Metabolisme composante proteomique (PFEMcp), France) ,  Hebraud Michel (Institut National de la Recherche Agronomique, Centre Auvergne-Rhone-Alpes, Plate-Forme d’Exploration du Metabolisme composante proteomique (PFEMcp), France) ,  Hebraud Michel (Institut National de la Recherche Agronomique, Centre Auvergne-Rhone-Alpes, UR454 Microbiologie, France) ,  Poeta Patricia (UCIBIO-REQUIMTE, Faculty of Science and Technology, University NOVA of Lisbon, Caparica, Portugal) ,  Poeta Patricia (Veterinary Science Department, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Igrejas Gilberto (Functional Genomics and Proteomics Unit, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Igrejas Gilberto (Department of Genetics and Biotechnology, University of Tras-os-Montes and Alto Douro, Vila Real, Portugal) ,  Igrejas Gilberto (UCIBIO-REQUIMTE, Faculty of Science and Technology, University NOVA of Lisbon, Caparica, Portugal)
資料名： Journal of Proteomics  (Journal of Proteomics)
巻： 145  ページ： 103-111  発行年： 2016年 
JST資料番号： T0073A  ISSN： 1874-3919  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Escherichia coliは動物およびヒトの消化管の共生微生物であり,抗生物質耐性機構の研究のための優れたモデル生物である。細菌の耐性伝送と他の特性は細菌の進化を通して生じる遺伝子移動の異なるタイプに基づいている。の一つは,新しい遺伝子を獲得する細菌の能力を理解することを可能にする水平遺伝子移動である。一次元と二次元電気泳動(2 DE)法を二種類のE.coli株のプロテオームを同定し,特性化するために実施した:Electromax DH10B,変態準備歪TF Se20,aac(6′)-Ib cr4潜伏pMdT1プラスミドを含むElectromax DH10B。マトリックス支援レーザ脱離/イオン化飛行時間型質量分析(MALDI TOF MS)の2-DEとその後の分析後,TF Se20歪に与える76種の異なった蛋白質を同定することができ,一方,71は既知の機能を持っていた。Electromax DH10B株から,72の異なる蛋白質が,そのうちの71は生物学的プロセスと関連していた同定した。関心のある蛋白質,アミノグリコシドN-(6′)-アセチルトランスフェラーゼ1型,MALDI-TOFにより同定した。液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析(LC MS/MS)技術は,その配列を決定した。アセチラーゼ配列の七十六%はTF Se20歪だけで再構築し,抗生物質耐性に関連する単一蛋白質を示した。MALDI-TOFMS及びLC-MS/MSアプローチは,両菌株の全プロテオーム,アセチラーゼ配列を決定することができた。両者は抗菌薬耐性の機構についてのより正確な情報を得るために能力を増強した。pMdT1プラスミドは抗生物質耐性をもたらすことを理解代謝過程に新しい展望をもたらす。本研究は,遺伝子導入と抗生物質耐性の機構の理解におけるプロテオミクスとバイオインフォマティクスの重要性を強調した。これらの二つのアプローチは,種々の試料中の蛋白質発現,並びに各蛋白質に関連した種々の生物学的プロセスを比較することを可能にする。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *プラスミド ,  タンパク質 ,  プロテオーム ,  再構成 ,  遺伝子導入 ,  アセチルトランスフェラーゼ ,  キャラクタリゼーション ,  ヒト ,  *プロテオミクス ,  MALDI-TOF MS ,  二次元電気泳動 ,  飛行時間法
準シソーラス用語： 蛋白質発現 ,  バイオインフォマティクス ,  LC/MS/MS ,  微生物薬物耐性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Escherichia coli ,  AAC-(6′)-lb Cr ,  pMdT1プラスミド ,  抗生物質耐性 ,  遺伝子移動の機構 ,  MALDI-TOF MSとLC-MS/MS

分類 (1件)： 生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (3件)： Escherichia ,  評価 ,  プラスミド