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J-GLOBAL ID：201702244051587199   整理番号：17A0074365

ジャガイモ82菌株の遺伝子組換え蛋白質シグナルペプチドの分析を行った。【JST・京大機械翻訳】

Computational Analysis of Secreting Signal Petides Encoded by Plasmid Genome of Ralstonia solanacearum Po82 Bacteria

著者 (6件)： Yang Junyu (Key Laboratory of Bio-diversity for Plant Diseases Management of Ministry of Education,Yunnan Agricultural University) ,  Zhang Zhichao (Key Laboratory of Bio-diversity for Plant Diseases Management of Ministry of Education,Yunnan Agricultural University) ,  Han Yonghua (Key Laboratory of Bio-diversity for Plant Diseases Management of Ministry of Education,Yunnan Agricultural University) ,  Li Jie (Key Laboratory of Bio-diversity for Plant Diseases Management of Ministry of Education,Yunnan Agricultural University) ,  Zhang Yu (Key Laboratory of Bio-diversity for Plant Diseases Management of Ministry of Education,Yunnan Agricultural University) ,  Huang Qiong (Key Laboratory of Bio-diversity for Plant Diseases Management of Ministry of Education,Yunnan Agricultural University; State Key Laboratory of Conservation and Utilization of Biological Resources in Yunnan)
資料名： Xinan Nongye Xuebao  (Xinan Nongye Xuebao)
巻： 29  号： 5  ページ： 1121-1127  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3020A  ISSN： 1001-4829  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 計算機技術とバイオインフォマティクスの方法を応用し、SIGNALP4.0、1.0,7551.0、TARGETP1.0を採用した。1,,2.0蛋白質分析ソフトを用いて,植物病原菌RALSTONIA SOLANACEARUM PO82プラスミドのゲノムの1680個のORFSコードの分泌タンパク質のシグナルペプチドのアミノ酸配列に対して予測分析を行った。結果により、プラスミド遺伝子組の1680個のORFSの中に102個のORFSがコードするタンパク質がN-末端シグナルペプチド配列を持ち、85個のI型シグナルペプチド、1個のII型シグナルペプチド、15個のPREPILIN-LIKEシグナルペプチドと1個のバクテリオシンとフェロモンシグナルペプチドを含むことが分かった。すべての分泌蛋白質にはRR-MOTIFシグナルペプチド構造を持つ14個があり,I型シグナルペプチドであった。102個の切断シグナルペプチドを有する分泌蛋白質のうち,50.98%の蛋白質は細胞外分泌型(S型),33.33%はミトコンドリア分泌型(M型),6.87は葉緑体分泌型(C型),%は他のタイプの分泌蛋白質である。シグナルペプチド切断部位のアミノ酸組成は非極性アミノ酸が53.27%、極性アミノ酸が18.79%、負電荷を持つ酸性アミノ酸が%%、正電荷を持つ塩基性アミノ酸が8.82%であった。Rを比較した。SOLANACEARUM GMI1000とR。SOLANACEARUM PO82プラスミドのシグナルペプチドタイプの違いは,これら2種類の菌がシグナルペプチドタイプに大きな差があることを見出した。本論文では,Rを用いた。SOLANACEARUM PO82プラスミドのシグナルペプチド分泌タンパク質の研究は,この病原菌とTRITICINAの病原機構が長期進化における独特な地位を明らかにした。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分泌タンパク質 ,  *シグナルペプチド ,  アミノ酸 ,  バクテリオシン ,  植物病原菌 ,  アミノ酸配列 ,  極性 ,  プラスミド ,  アミノ酸組成 ,  負電荷 ,  ミトコンドリア ,  ゲノム ,  *組換タンパク質 ,  *ジャガイモ
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Bioinformatics ,  Ralstonia solanacearum ,  Secreting signal peptides ,  Plasmid genome

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： ジャガイモ ,  菌株 ,  遺伝子 ,  組換え蛋白質 ,  シグナルペプチド ,  分析