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J-GLOBAL ID：201702247720161128   整理番号：17A0064327

トウガラシTPSファミリーメンバーの同定とCATPS1の発現解析【JST・京大機械翻訳】

Identification of CaTPS Gene Family and Expression Analysis of CaTPS1 in Hot Pepper

著者 (6件)： Wei Bingqiang (College of Horticulture,Gansu Agricultural University) ,  Wang Lanlan (Institute of Vegetable,Gansu Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Ru (Institute of Vegetable,Gansu Academy of Agricultural Sciences) ,  Chen Lingzhi (Institute of Vegetable,Gansu Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Shaoli (Institute of Vegetable,Gansu Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Jiannong (College of Horticulture,Gansu Agricultural University)
資料名： Yuanyi Xuebao  (Yuanyi Xuebao)
巻： 43  号： 8  ページ： 1504-1512  発行年： 2016年 
JST資料番号： W1457A  ISSN： 0513-353X  CODEN： YUHPAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 生物情報学的方法を用いて,トウガラシの全ゲノムデータベースから11個のTPS遺伝子を同定し,CATPS3は1個のTPSと2個のTPPドメインを含み,残りは1個のTPSと1個のTPPドメインを含むことを示した。11のCATPSは2つのクラスに分類され,CLASSは1つの遺伝子(CATPS1~ 3)を含み,それぞれ16,16と13のイントロンを含み,CATPS1とCATPS2はモチーフ1~モチーフ5を含んでいた。に3は2つのモチーフ4と1つのモチーフ3を含んでいる。CLASSIIは8つの遺伝子(CATPS4~ 11)を含み,2つのイントロンを含み,それぞれモチーフ1~モチーフ6の1つを含んでいた。トウガラシの組織におけるCATPS1の特異性と低温応答パターンを蛍光定量的PCRによって分析した。CATPS1の葉における発現量は根と茎の5~6倍であり、CATPS1の発現には明らかな組織特異性があることを示した。低温処理後のCATPS1の根と茎における発現ピークの出現時間は明らかに葉より早く、異なる組織におけるCATPS1の低温ストレスに対する応答時間には一定の差異があることを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 組織特異性 ,  低温 ,  *トウガラシ ,  遺伝子 ,  蛍光 ,  寒冷ストレス ,  イントロン ,  定量的PCR法 ,  応答時間
準シソーラス用語： 低温処理 ,  特異性 ,  ゲノムデータベース ,  バイオインフォマティクス ,  *遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： hot pepper ,  trehalose-6-phosphate synthase gene ,  genomic identification ,  gene expression

分類 (4件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  物質の代謝  (EH02050Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： トウガラシ ,  ファミリー ,  メンバー ,  同定 ,  発現解析