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J-GLOBAL ID：201702247733820114   整理番号：17A0685632

水モデルの選択に対する蛋白質ガラス転移の感度

Sensitivity of Protein Glass Transition to the Choice of Water Model

著者 (3件)： GUPTA Madhulika (Indian Inst. of Technol.-Delhi, New Delhi, IND) ,  CHAKRAVARTY Charusita (Indian Inst. of Technol.-Delhi, New Delhi, IND) ,  BANDYOPADHYAY Sanjoy (Indian Inst. of Technol.-Kharagpur, Kharagpur, IND)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 12  号： 11  ページ： 5643-5655  発行年： 2016年11月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： CHARMM2力の場による水モデルを用いた分子動力学シミュレーションを用いて,水モデルの選択に対するトリプトファン-ケージミニ蛋白質の蛋白質ガラス転移および動力学を調べた。蛋白質およびその水和水の相関動力学交差を蛋白質構造およびその水和水分子の規則化の解析が示した。異なる水分子のパラメータ化は,ペプチドの動力学交差に対する開始温度のプローブに対し十分であることを示した。

シソーラス用語： *水モデル ,  *タンパク質 ,  *ガラス転移 ,  *感度 ,  プログラムパッケージ ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  力の場 ,  アミノ酸 ,  動力学 ,  結合水 ,  分子構造 ,  規則化 ,  水分子 ,  パラメタリゼーション ,  分子動力学シミュレーション ,  水和水 ,  タンパク質構造 ,  計算機利用 ,  利用 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： CHARMM ,  パラメータ化

分類 (3件)： オペレーションズリサーチ一般  (KA03010Q) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  相転移・臨界現象一般  (BL04010V)

物質索引 (1件)： トリプトファン

タイトルに関連する用語 (4件)： 水モデル ,  蛋白質 ,  ガラス転移 ,  感度