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J-GLOBAL ID：201702254042929950   整理番号：17A0200228

2型糖尿病患者の腸内微生物叢における機能的ネットワークの構築と解析【Powered by NICT】

Construction and Analysis of Functional Networks in the Gut Microbiome of Type 2 Diabetes Patients

著者 (6件)： Li Lianshuo (TNLIST/Department of Automation, Tsinghua University) ,  Wang Zicheng (TNLIST/Department of Automation, Tsinghua University) ,  He Peng (TNLIST/Department of Automation, Tsinghua University) ,  Ma Shining (TNLIST/Department of Automation, Tsinghua University) ,  Du Jie (Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University, Beijing Institute of Heart, Lung, and Blood Vessel Diseases) ,  Jiang Rui (TNLIST/Department of Automation, Tsinghua University)
資料名： Jiyinzu Danbaizhizu yu Shengwu Xinxi Xuebao(Yingwenban)  (Jiyinzu Danbaizhizu yu Shengwu Xinxi Xuebao(Yingwenban))
巻： 14  号： 5  ページ： 314-324  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2620A  ISSN： 1672-0229  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微生物種のネットワークは,ミクロビオームの16S rRNA配列データの解析に広く使用されているが,完全な微生物遺伝子ネットワークの構築と分析することは,メタボゲノミクス研究における微生物遺伝子の大きな数のために,一般的に問題がある。この限界を克服するために,著者らは,KEGGオーソロガス群と遺伝子:教師なしオーソロガスグループ(eggNOG)オーソロガス群の進化的家系を含む,機能ユニットへの微生物遺伝子を地図化微生物の機能的ネットワークの構築と解析を可能にすることを提案した。は2型糖尿病(T2D)患者と同様に健常対照者からの腸内マイクロバイオームのディープシークエンシングデータセットに基づく微生物機能単位間の組ごとの関係を推論するための二統計的方法を考案した。ネットワークなどの機能性単位とそれらの有意な相互作用を含むを続いて作成した。得られた機能的ネットワークにおける大域的性質,局所的性質,機能モジュールの解析を行った。著者らのデータは,現在の知識と一致観測に加えて,本研究では,T2Dに関連した腸内常在菌叢ゲノムへの新しい生物学的洞察を提供することを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *患者 ,  統計的方法 ,  遺伝子 ,  *腸内微生物 ,  家系 ,  *ネットワーク ,  相互作用 ,  *2型糖尿病 ,  *微生物
準シソーラス用語： メタゲノミクス ,  機能性 ,  KEGG ,  微生物遺伝子 ,  16S rRNA ,  常在菌叢ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 機能的ネットワーク ,  ミクロビオーム ,  2型糖尿病 ,  メタゲノミクス ,  ネットワークモチーフ

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C)

タイトルに関連する用語 (5件)： 2型糖尿病 ,  患者 ,  腸内微生物 ,  構築 ,  解析