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J-GLOBAL ID：201702256875527413   整理番号：17A0411555

Indigofera barberiからの画分および化合物の抗菌有効性:薬理作用団ベースの仮想スクリーニングを通したDNAジャイレースB阻害剤の同定【Powered by NICT】

Antibacterial efficacy of fractions and compounds from Indigofera barberi: Identification of DNA gyrase B inhibitors through pharmacophore based virtual screening

著者 (8件)： Bhaskar Baki Vijaya (Division of Molecular Biology, Bioinformatics Center, Department of Zoology, Sri Venkateswara University, Tirupati, 517 502, AP, India) ,  Mohan Aluru Ram (Division of Bioorganic Natural Products, Department of Chemistry, Sri Venkateswara University, Tirupati, 517 502, AP, India) ,  Babu Tirumalasetty Muni Chandra (Division of Molecular Biology, Bioinformatics Center, Department of Zoology, Sri Venkateswara University, Tirupati, 517 502, AP, India) ,  Rajesh Sivarathri Siva (Structural Biology Laboratory, Department of Bioinformatics, School of Chemical and Biotechnology, SASTRA University, Thanjavur, 613 401, TN, India) ,  Bhuvaneswar Cherukupalle (Department of Microbiology, Sri Venkateswara University, Tirupati, 517 502, AP, India) ,  Sivaraman Thirunavakkarasu (Structural Biology Laboratory, Department of Bioinformatics, School of Chemical and Biotechnology, SASTRA University, Thanjavur, 613 401, TN, India) ,  Gunasekar Duvvuru (Division of Bioorganic Natural Products, Department of Chemistry, Sri Venkateswara University, Tirupati, 517 502, AP, India) ,  Rajendra Wudayagiri (Division of Molecular Biology, Bioinformatics Center, Department of Zoology, Sri Venkateswara University, Tirupati, 517 502, AP, India)
資料名： Process Biochemistry  (Process Biochemistry)
巻： 51  号： 12  ページ： 2208-2221  発行年： 2016年 
JST資料番号： C0250B  ISSN： 1359-5113  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多剤耐性(MDR)グラム陰性細菌感染症が真に治療不能,病院で最も一般的および治療上の評決は非常に取り上げられた。本研究では,二種の化合物(クエルセチンとピニトール)および画分を,クロマトグラフィーおよびNMR研究を用いたIndigofera barberiから単離し,特性化した。抗菌アッセイは,IB Me,IBDとIBE画分を明らかにし,ケルセチンは緑膿菌,E.coli,Klebsiella pneumoniaとCitrobactersp.のような臨床的に分離された細菌に対する説得力抗菌活性を示した。分子ドッキング研究は,ケルセチンがDNAジャイレースBと最も高い結合親和性を示した,続いて十一薬理作用団の特徴,即ち五HBD/HBA,二疎水性,HBAと三芳香族(Pi)環はMOEを用いて同定した示した。(GB/VI)薬理作用団ベースの仮想スクリーニング,ドッキング,結合エネルギーと結合親和性Born体積を用いた研究は,特異的にDNAジャイレースのATPポケット内Asn46,Asp73,Arg76,Thr163,Lys103,Arg136残基と保存された水分子と相互作用した十三リード分子を示した。これらの足場は五のLipinski則に適合し,薬物化合物として審議され毒性と薬物らしさ特性。,これらの化合物はMDRグラム陰性細菌感染の臨床管理における新規化合物として考えられる説得力のあるDNAジャイレースB阻害剤として支持できた。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *ドッキング ,  結合エネルギー ,  緑膿菌 ,  多剤耐性 ,  細菌感染 ,  モデリング ,  水分子 ,  抗細菌作用 ,  疎水性 ,  キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： 結合親和性 ,  分子ドッキング ,  *阻害剤 ,  *DNAギラーゼ ,  *バーチャルスクリーニング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Indigofera barberi ,  MDRグラム~-νe細菌 ,  MIC ,  ドッキング ,  MDシミュレーション ,  薬理作用団モデリング

分類 (3件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  酵素生理  (EG03052C) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (9件)： Indigofera ,  画分 ,  抗菌 ,  有効性 ,  薬理作用団 ,  仮想スクリーニング ,  DNAジャイレース ,  阻害剤 ,  同定