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J-GLOBAL ID：201702257642201507   整理番号：17A0575072

SAGE:外来蛋白質足場にグラフトする線状エピトープの高速計算ツール

SAGE: A Fast Computational Tool for Linear Epitope Grafting onto a Foreign Protein Scaffold

著者 (5件)： CAPELLI Riccardo (Universita degli Studi di Milano, Milan, ITA) ,  CAPELLI Riccardo (Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare, Consiglio Nazionale delle Ricerche, Milan, ITA) ,  MARCHETTI Filippo (Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare, Consiglio Nazionale delle Ricerche, Milan, ITA) ,  TIANA Guido (Universita degli Studi di Milano, Milan, ITA) ,  COLOMBO Giorgio (Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare, Consiglio Nazionale delle Ricerche, Milan, ITA)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 57  号： 1  ページ： 6-10  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 外来蛋白質にエピトープを導入しワクチンの効率を高めることを目指す場合に役立つ計算ツールとしてSAGE(strategy for alignment and grafting of epitopes)を開発した。足場の二次構造に関して,エピトープを導入したときの変化を導入部位のスキャンで比較し,抗原として最もふさわしいものを選択する。HIVエンベロープ蛋白質gp41のエピトープを足場蛋白質に導入した以前の実験結果を用いて,この計算法の有効性を検証した。この方法は汎用性がある。

シソーラス用語： *エピトープ ,  タンパク質 ,  二次構造 ,  アミノ酸配列 ,  *予測技法 ,  ワクチン ,  表面構造 ,  融合タンパク質 ,  HIV1 ,  ウイルスタンパク質
準シソーラス用語： 蛋白質二次構造 ,  *蛋白質構造予測 ,  HIVエンベロープ蛋白質gp41 ,  SAGE【エピトープ】

分類 (2件)： 免疫療法薬・血液製剤の基礎研究  (GW22010D) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： SAGE ,  外来 ,  蛋白質 ,  足場 ,  グラフト ,  エピトープ ,  高速計算 ,  ツール