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J-GLOBAL ID：201702261836138151   整理番号：17A0158604

中国におけるピロリ菌のゲノム多様性と個体群構造解析【JST・京大機械翻訳】

Genomic diversity and population structure of Helicobacter pylori isolates in China

著者 (5件)： You Yuanhai (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control,Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases,National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention) ,  He Lihua (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control,Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases,National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention) ,  Peng Xianhui (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control,Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases,National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention) ,  Sun Lu (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control,Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases,National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention) ,  Zhang Jianzhong (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control,Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases,National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention)
資料名： Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi  (Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi)
巻： 37  号： 10  ページ： 1397-1403  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2330A  ISSN： 0254-6450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】中国のHELICOBACTER PYLORI(HP)のゲノム特性と個体群構造を研究する。方法:中国の異なる地域の異なる疾患から分離した10株のHPのゲノム配列を利用し、公共データベース中のその他の地域のHPゲノムデータを統合し、比較ゲノムと生物情報学方法により中国HPのゲノムと個体群構造特徴を分析した。結果:中国のHPコア遺伝子は3個であった。菌株特異基は19?32個のこれらの遺伝子は中国のHPが異なる地域、異なる疾病宿主における適応性進化に関連している可能性がある。ゲノムの大きな領域は主にコード化修飾システムの遺伝子と四型分泌系をコードする遺伝子に集中している。コア遺伝子の一塩基多型(SNP)に基づく個体群分析により、中国株はいずれもHPEASTASIA群、,亜群に属し、しかも異なる地域の菌株は地域集中性の特徴があることが分かった。3つの中国HP遺伝子配列においてファージ配列を発見し,ファージ組立に必要な必須素子を保有した。結論:コアゲノムのSNP分析によると、中国株はいずれもHPEASTASIA群、,亜群に属し、しかも地域集中性を有する。中国の異なる地域における異なる疾患に関連するHPの遺伝的特徴を深く発掘し、HPの進化と病原におけるファージの役割を研究するために基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *Helicobacter pylori ,  データベース ,  バクテリオファージ ,  *ゲノム ,  一塩基多型 ,  遺伝 ,  適応性 ,  *個体群 ,  *中華人民共和国
準シソーラス用語： 遺伝子配列 ,  菌株 ,  バイオインフォマティクス ,  比較ゲノミクス ,  ゲノム配列 ,  *個体群構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Helicobacter pylori ,  Population structure ,  Genome

分類 (6件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  胃  (EJ06030C) ,  消化器の疾患  (GH03000W) ,  消化器の診断  (GH02000P) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  感染症・寄生虫症の診断  (GD01020S)

タイトルに関連する用語 (6件)： 中国 ,  ピロリ菌 ,  ゲノム ,  多様性 ,  個体群構造 ,  解析