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J-GLOBAL ID:201702261894754288   整理番号:17A0440028

精子射精後寿命間のアクチンダイナミックスのネットワークモデル:人が構築したモデルとテキストマイニングベースモデルの比較

Networks Models of Actin Dynamics during Spermatozoa Postejaculatory Life: A Comparison among Human-Made and Text Mining-Based Models
著者 (6件):
資料名:
巻: 2016  号: Computational Biology  ページ: ROMBUNNO.9795409 (WEB ONLY)  発行年: 2016年 
JST資料番号: U7008A  ISSN: 2314-6133  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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本論文では,ヒトの精子の受精能獲得の間に生じるアクチンリモデリング過程を表現するネットワークベースモデル(HumanMade_ActinSpermNetwork,HM_ASN)を構築した。そして,それを2つの異なるテキストマイニングツール:Agilent Literature Search(ALS)とPESCADOR,によって与えられるネットワークと比較した。参照源として,より一般的な生物学的文脈におけるアクチンダイナミックスとして参照されるオンラインリポジトリKyoto Encyclopaedia of Genes andGenomes(KEGG)からのデータを用いた。HM_ASNとKEGGデータからのネットワークはBarabasi-Albertモデルに従う同じスケールフリートポロジーを共有することを見出した。即ち,情報はネットワーク内に迅速に効率的に拡散することを示唆する。逆に,ALSとPESCADORから得られたネットワークはスケールフリー階層的アーキテクチャを有し,異なった情報伝達パターンを意味する。また,ネットワーク内に特定されたハブは異なる:HM_ASNとKEGGネットワークはハブとして,アクチン情報伝達に係わることが知られているいくつかの分子を含んでいる;ALSは“アクチン”以外の他のハブを見出すことができず,PESCADORは特定できない結果を与えた。これは,ヒトの精子におけるアクチンダイナミックスなどの特定事象における人が構築した情報検索は,信頼できる戦略であることを示唆する。(翻訳著者抄録)
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分類 (2件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
生殖器官  ,  人工知能 

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