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J-GLOBAL ID：201702262295954463   整理番号：17A0071337

細胞周期の高分解能trariscriptome地図は周期的遺伝子と癌との新たな関係を明らかにする【Powered by NICT】

A high-resolution trariscriptome map of cell cycle reveals novel connections between periodic genes and cancer

著者 (6件)： Dominguez Daniel (Department of Pharmacology,University of North Carolina at Chapel Hill) ,  Tsai Yihsuan (Department of Pharmacology,University of North Carolina at Chapel Hill) ,  Gomez Nicholas (Lineberger Comprehensive Cancer Center,University of North Carolina at Chapel Hill) ,  Jha Deepak Kumar (Department of Biochemistry and Biophysics, University of North Carolina at Chapel Hill) ,  Ian Davis (Lineberger Comprehensive Cancer Center,University of North Carolina at Chapel Hill) ,  Wang Zefeng (Department of Pharmacology,University of North Carolina at Chapel Hill)
資料名： Cell Research  (Cell Research)
巻： 26  号： 8  ページ： 946-962  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2561A  ISSN： 1001-0602  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞周期を通しての進行は周期的遺伝子発現の波に大きく依存する,これらのトランスクリプトーム動力学のための調節ネットワークは腫瘍生物学の様々な側面の脆弱性の臨界点として出現した。二連続細胞サイクル(>二十三億対の読み取り)中のヒト細胞のRNA配列決定により,1000mRNAs,nonコードRNAと偽遺伝子の周期的発現を同定した。周期転写物はDNA代謝,有糸分裂,およびDNA損傷応答に関連した機能に濃縮され,これらの遺伝子は推定上の細胞周期調節因子を示す可能性があることを示している。周期的遺伝子のセットを用いて,異なる細胞周期段階へのトランスクリプトーム類似性による原発腫瘍と正常組織を分類できることを「有糸分裂形質」と呼ばれる新しい手法を開発した。>4000腫瘍試料の分析癌ゲノムアトラス(TCGA)と他の発現データセットは,有糸分裂形質は遺伝的変化,腫瘍サブタイプと,特に,患者の生存と有意に相関することを見出した。は,複数の細胞型におけるロバストな周期的な発現を示す67遺伝子のコアセットを定義した。これらの遺伝子によりコードされる蛋白質は,蛋白質-蛋白質相互作用の主要なハブとして機能し,細胞周期進行に必要な大部分。コア遺伝子もCTCF/RAD21結合とH3K36me3のレベル増加を含むユニークなクロマチンの特徴を持っている。子宮と腎臓癌におけるこれらの特徴の消失はコア67遺伝子の発現変化と関連している。著者らの研究は,周期的遺伝子調節のための新しいクロマチン結合機構を示唆し,癌患者の転帰の予測因子を提供する。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： クロマチン ,  患者 ,  *細胞周期 ,  腫瘍 ,  トランスクリプトーム ,  *高分解能 ,  *遺伝 ,  ロバスト性 ,  類似性 ,  ヒト ,  *遺伝子 ,  有糸分裂 ,  CTCF ,  蛋白質間相互作用 ,  遺伝子発現調整
準シソーラス用語： 遺伝的調節 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 細胞周期 ,  周期的トランスクリプトーム ,  後成的制御 ,  有糸分裂形質

分類 (1件)： 細胞分裂・増殖  (EF02020D)

タイトルに関連する用語 (5件)： 細胞周期 ,  高分解能 ,  地図 ,  遺伝子 ,  癌