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J-GLOBAL ID：201702262330786916   整理番号：17A0167253

RNA-SEQ技術に基づくチャのトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Analysis of Flower from Tea Plant [Camellia sinensis (L. ) O. Kuntz] via RNA-Seq Technology

著者 (8件)： Xia Lifei (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation) ,  Zhu Xingzheng (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation) ,  Liang Mingzhi (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation) ,  Ma Wei (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation) ,  Song Weixi (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation) ,  Tian Yiping (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation) ,  Zhou Meng (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation) ,  Chen Linbo (Tea Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences/Yunnan Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Matching Cultivation)
資料名： Xinan Nongye Xuebao  (Xinan Nongye Xuebao)
巻： 29  号： 9  ページ： 2058-2062  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3020A  ISSN： 1001-4829  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では、RNA-SEQ技術を利用して、父本、母本、子代の不稔性の3つのサンプルの花のトランスクリプトームを測定し、組立分析により、403469本の高品質のUNIGENESを得た。得られたUNIGENESをSWISS-PROT,TREMBL,CDD,PFAM,NRおよびKOGライブラリーとブラストし,307291本のUNIGENESをアノテーションした。KOG機能分類は,23739個のUNIGENESが25種類に分類されていることを示した。KEGG経路分析により、26967個のUNIGENESが関与するPATHWAYが328個あることが分かった。SSR検出により,403469個のUNIGENESから46440個のSSR配列を見出した。これらの情報は茶の不稔性遺伝子のスクリーニング、不稔メカニズムの研究及び分子マーカーの開発に基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アノテーション ,  不稔 ,  *トランスクリプトーム ,  遺伝子 ,  *RNA【核酸】
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  KEGG ,  高品質 ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Camellia sinensis ,  Transcriptome sequencing ,  Sterility gene ,  Molecular marker

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (2件)： チャ ,  トランスクリプトーム解析