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J-GLOBAL ID：201702280879218633   整理番号：17A0200846

Lian瓣Lan花のトランスクリプトームおよびMADS遺伝子ファミリーのマイニング【JST・京大機械翻訳】

Floral Transcriptome Sequencing and Characteristic Analysis of Cymbidium tortisepalum

著者 (9件)： Xiao Jingyi (Yunnan Agricultural University) ,  Zhu Yongping (Yunnan Agricultural University) ,  Jiang Zhou (Yunnan Agricultural University) ,  Jia Rong (Yunnan Agricultural University) ,  Wu Linxian (Yunnan Agricultural University) ,  Yu Kun (Institute of Agricultural Technology Extension of Yunnan Province, Jianshui County) ,  Xu Yufeng (Seed Administration Station, HuizeCounty, Yunnan Province) ,  Zhang Yinghua (Yunnan Agricultural University) ,  He Fengmei (Yunnan Agricultural University)
資料名： Fenzi Zhiwu Yuzhong  (Fenzi Zhiwu Yuzhong)
巻： 14  号： 10  ページ： 2610-2616  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2681A  ISSN： 1672-416X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： Lian瓣Lanは中国の貴重な花の野生資源であり、高い観賞価値があるが、それに関連する分子生物学の研究はまだ空白である。Lian瓣Lanの花形成の分子機構を明らかにするために,ハイスループット配列決定技術を用いて,Lian瓣Lan花のトランスクリプトーム解析を行った。生物学的情報分析により,オリジナルのつが得られた。得られたUNIGENEは,NR,PROT-PROT,COGおよびKEGGデータベースとの比較により,UNIGENEのアノテーション量が24本であり,約32本のUNIGENEが注釈を得ていないことを示した。これらの得られなかったアノテーション遺伝子は,Lian瓣Lanという新しい転写物と特異的遺伝子であると考えられる。36のCDS遺伝子はMADSボックス遺伝子として注釈され,系統樹を構築し,31のMADSボックス遺伝子をクラスター化し,そのうち23の花は花の発育に関連するABCDE遺伝子であり,8つは開花時期に関連するMADS遺伝子であった。同時に、PI、AP3とAGL6遺伝子の発現量が比較的高く、この試験はシンビジウムの花の発育及び開花メカニズムの研究に一定の理論的根拠を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 開花 ,  アノテーション ,  分子生物学 ,  クラスタ化 ,  *トランスクリプトーム ,  *遺伝子 ,  データベース ,  シュンラン属 ,  系統樹
準シソーラス用語： MADSボックス遺伝子 ,  KEGG ,  トランスクリプトーム解析 ,  ハイスループット ,  分子機構 ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Cymbidium tortisepalum ,  Flower ,  Transcriptome ,  Specificity analysis

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： LAN ,  花 ,  トランスクリプトーム ,  遺伝子ファミリー