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J-GLOBAL ID：201702281289652440   整理番号：17A0080113

生理学的脂質のシミュレーションのモデルパラメータ

Model parameters for simulation of physiological lipids

著者 (2件)： Hills Ronald D. (Department of Pharmaceutical Sciences, College of Pharmacy, University of New England, 716 Stevens Ave, Portland, Maine, 04103) ,  McGlinchey Nicholas (Department of Pharmaceutical Sciences, College of Pharmacy, University of New England, 716 Stevens Ave, Portland, Maine, 04103)
資料名： Journal of Computational Chemistry  (Journal of Computational Chemistry)
巻： 37  号： 12  ページ： 1112-1118  発行年： 2016年05月05日 
JST資料番号： C0111B  ISSN： 0192-8651  CODEN： JCCHDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生理学的膜環境の蛋白質粗粒子シミュレーションは時間スケールの洞察を提供できるが,包括的力場を必要とする。不飽和脂質DOPCとDOPE,混合鎖飽和POPCとPOPE,細菌で見出された陰イオン性脂質:POPGとカルジオリピンから成る多成分二重層のパラメータについて調べた。マルチスケールフォースマッチングから得た非結合表現をこれらの脂質に適合して,コレステロールの改善結合記述と組み合わせた。脂質当たりの領域平衡化は,非ラメラ相形成傾向が知られている純粋DOPEを除いて,一般的脂質混合物のロバスト性二重層シミュレーションと特性を与えた。そのモデルは,既存の脂質-蛋白質間相互作用モデルとの整合性を維持して,生理学的に代表的な二重層の膜蛋白質を研究するために有用な力場を形成した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *脂質二分子膜 ,  カルジオリピン ,  *計算機シミュレーション ,  モデル ,  *パラメータ ,  力の場 ,  細胞膜 ,  *リン脂質 ,  脂肪族カルボン酸 ,  ジグリセリド ,  オレフィン化合物 ,  不飽和カルボン酸 ,  無機酸エステル ,  第四アンモニウム ,  アミノアルコール ,  ステロール ,  脂環式アルコール
準シソーラス用語： *モデルパラメータ ,  原子論的シミュレーション ,  粗視化モデル ,  分子動態シミュレーション

著者キーワード (5件)： coarse-grained force field ,  mixed lipid bilayer ,  area per lipid ,  implicit solvent ,  molecular dynamics

分類 (1件)： 生体膜一般  (EF04010G)

物質索引 (4件)： DOPC ,  DOPE ,  POPG ,  コレステロール

タイトルに関連する用語 (4件)： 生理学 ,  脂質 ,  シミュレーション ,  モデルパラメータ