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J-GLOBAL ID：201702286801560715   整理番号：17A0704053

強力な抗Helicobacter pylori剤としてSyzygium alternifoliumからのフラボノイドの分子ドッキング,分子動力学シミュレーション,生物学的評価および2D QSAR解析【Powered by NICT】

Molecular docking, molecular dynamics simulation, biological evaluation and 2D QSAR analysis of flavonoids from Syzygium alternifolium as potent anti-Helicobacter pylori agents

著者 (7件)： Chandra Babu Tirumalasetty Muni (Bioinformatics Center, Division of Molecular Biology, Department of Zoology, Sri Venkateswara University, Tirupati - 517 502, Andhra Pradesh, India. [e-mail]) ,  Rajesh Sivarathri Siva ,  Bhaskar Baki Vijaya ,  Devi Savita ,  Rammohan Aluru ,  Sivaraman Thirunavakkarasu ,  Rajendra Wudayagiri
資料名： RSC Advances (Web)  (RSC Advances (Web))
巻： 7  号： 30  ページ： 18277-18292  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7055A  ISSN： 2046-2069  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,Syzygium alternifolium果実の三種のフラボノイド類,即ち5-ヒドロキシ-7,4′-ジメトキシ-6,8-ジ-C-メチルフラボン(1),ケンペロール,3OβDグルコピラノシド(2)及びケンペロール,3OαLラムノピラノシド(3),の抗Helicobacter pylori(Hp)とウレアーゼ阻害活性を評価するために特定の目的で行った。これらのフラボノイドは二Hp株,Hp26695とHp P12に対する抗H.pylori活性を調べ,時間殺菌動態研究マイクロブロス希釈アッセイ,AGS(胃表皮細胞)によるH.pyloriコロニー形成を低下させる能力を評価した。添加では,標的蛋白質,ウレアーゼおよび細胞毒関連遺伝子(Cag A)とこれらの化合物に対するこれらの化合物を実施し,その後,2D QSAR,分子ドッキングと分子動力学シミュレーションによるたウレアーゼ阻害分析。in vitro研究は,アモキシシリンと比較した場合,化合物2と3は有意な抗H.pylori活性を示した化合物1は中程度の活性を示したが,これらの化合物はまた,時間依存的に強い殺菌動力学を示すことを示した。これらの化合物は,AGS細胞との接着の有意な損失をH.pyloriコロニー形成を潜在的に減らすとHpのウレアーゼ活性を阻害した。2D QSAR解析は,これらの化合物は,生物学的アッセイとRMSE=0.905およびR~2=0.820の許容できる相関を示すことを明らかにした。化合物は10ns分子動力学シミュレーションにより証明されたように,標的蛋白質の活性ポケット残基との水素結合相互作用を形成することにより強い阻害を示した。それ故,本研究はH.pylori感染に対する自然源からの強力な抗菌薬の発見のための新しいビジョンを提供するであろう。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 抗細菌薬 ,  *Helicobacter pylori ,  水素結合 ,  in vitro実験 ,  殺菌 ,  バイオアッセイ ,  ウレアーゼ ,  *フラボノイド ,  時間依存性 ,  *定量的構造活性相関 ,  遺伝子 ,  酸素複素環化合物 ,  多価フェノール ,  芳香族縮合化合物 ,  ヒドロキシケトン
準シソーラス用語： コロニー形成 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *分子ドッキング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 食品の分析  (FJ01030U) ,  ピランの縮合誘導体  (CF07093I) ,  生薬一般  (GX06010Y)

物質索引 (1件)： ケンペロール

タイトルに関連する用語 (8件)： Helicobacter ,  Syzygium ,  フラボノイド ,  分子ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  生物学的評価 ,  2D ,  QSAR解析