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J-GLOBAL ID：201702287193499695   整理番号：17A0109824

シタビラメ36遺伝子のCDNAクローンと発現解析を行った。【JST・京大機械翻訳】

Cloning and Expression Analysis of trim36 Gene in Half-smooth Tongue Sole (Cynoglossus semilaevis)

著者 (9件)： Wang Wenwen (College of Fisheries, Ocean University of China) ,  Zhu Ying (College of Fisheries, Ocean University of China) ,  Wei Zhanfei (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Sciences) ,  Zheng Weiwei (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Sciences) ,  Dong Zhongdian (College of Fisheries, Ocean University of China) ,  Gao Fengtao (College of Fisheries, Ocean University of China) ,  Shao Changwei (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Sciences) ,  Wen Haishen (College of Fisheries, Ocean University of China) ,  Chen Songlin (Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Sciences, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology)
資料名： Nongye Shengwu Jishu Xuebao  (Nongye Shengwu Jishu Xuebao)
巻： 24  号： 7  ページ： 968-979  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2715A  ISSN： 1674-7968  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 三重モチーフタンパク質(THE TRIPARTITE MOTIF-CONTAINING PROTEIN、TRIM)ファミリーは構造が保守的で、進化が速いE3ユビキチンリガーゼであり、多くの重要な生命過程に参与する。TRIM36はTRIMファミリーの一員であり,TRIM36はE3ユビキチンリガーゼをコードする。本研究では,完成 SEMILAEVISの完全ゲノム配列決定とトランスクリプトーム配列決定を行った。シタビラメ 36遺伝子(GENBANK受入番号:KU244470)をRACE法によりクローニングし,そのORFは2BPであり,そのORFは737アミノ酸をコードする2BPであった。5’非翻訳領域(UNTRANSLATED UTR,UTR)は289BP,3’UTRは396BPであった。生物情報学的分析は,シタビラメ36蛋白質が1つの亜鉛フィンガー構造を含み,2つのB-BOX型亜鉛フィンガー蛋白質ドメイン(B-BOX-TYPE ZINC FINGER,BBOX),1つのランダムコイル構造を含むことを示した。1つのカルボキシル末端のフィブロネクチンIII(FIBRONECTIN TYPE III,FN3)ドメインと1つの二重特異性プロテインキナーゼSPLAとリアノジン受容体(SPLA KINASE AND RYANODINE RECEPTOR, SPRY)ドメイン。また,異なる脊椎動物において,TRIM36遺伝子はその近傍の遺伝子と保存的な共線性関係を有していた。半定量的RT-PCRとQRT-PCRの結果は,シタビラメ36遺伝子の発現がシタビラメの異なる組織で異なっていることを示した。TRIM36の発現は卵巣で最も高く,次に雌と雄の脳で続いた。異なる発育段階において、TRIM 36遺伝子は120日齢の科の生殖腺で発現し始め、しかも卵巣の発現量は精巣より明らかに高かった(P<0.05)。IN SITUハイブリダイゼーションの結果,TRIM 36遺伝子のハイブリダイゼーション信号は主にI期とII期の卵母細胞に現れた。TRIM36の時空間的発現の特徴は,それが卵巣の形成とI期とII期の卵母細胞の形成において重要な役割を果たすことを示した。結果により、TRIM36は性別の発生において一定の作用があり、これは魚類のTRIM 36遺伝子機能及びTRIMファミリー遺伝子機能の更なる研究に手がかりと参考を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 精巣 ,  *遺伝子 ,  卵母細胞 ,  トランスクリプトーム ,  *クローン
準シソーラス用語： 遺伝子機能 ,  C末端 ,  亜鉛フィンガー蛋白質 ,  亜鉛フィンガー ,  バイオインフォマティクス ,  非翻訳領域 ,  クローニング ,  RACE法 ,  ゲノム配列 ,  *遺伝子発現プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Half smooth tongue sole ,  The tripartite motif- containing protein gene (trim36) ,  Cloning ,  qRTPCR ,  In situ hybridization

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子 ,  cDNAクローン ,  発現解析