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J-GLOBAL ID：201702287462191042   整理番号：17A0202335

CAS系の配列相同性プラスミドの薬剤耐性情報と赤痢菌の薬剤耐性との関係【JST・京大機械翻訳】

Information on the drug resistance of plasmids that are homologous to spacers in a CRISPR/Cas system and its relationship to information on the drug resistance of Shigella

著者 (9件)： Zhang Bing (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University) ,  Wang Pengfei (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University) ,  Duan Guangcai (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University; Henan Center for Innovation in Molecular Diagnosis and Laboratory Medicine) ,  Liang Wenjuan (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University; Henan Center for Innovation in Molecular Diagnosis and Laboratory Medicine) ,  Hong Lijuan (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University) ,  Wang Linlin (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University) ,  Guo Xiangjiao (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University) ,  Yang Haiyan (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University) ,  Xi Yuanlin (Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University)
資料名： Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi  (Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi)
巻： 11  号： 10  ページ： 881-887  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3057A  ISSN： 1673-5234  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:赤痢菌の薬剤耐性情報とその相同性プラスミドあるいはファージ耐性情報との関係を比較する。【方法】CRISPR TARGETとBLASTを用いて,スペーサープラスミドとファージを探索し,NCBIまたはGENBANKにおける標的遺伝子またはファージの薬剤耐性情報を,登録によって検出した。BIOEDITソフトウェアを用いて,GENBANKにおける赤痢菌の薬剤耐性情報を探索した。結果:データベースと臨床分離株の合計52のスペーサーのうち、7つのスペーサーと4つの薬剤耐性遺伝子を有するプラスミドの相同性があった。間隔2-MEL-3ホモログプラスミドPUMNF18_INCFVとと-SS1998011/,SS-SS1998024/,,-SF2005082/,,-SF2013004/,BJ-SF2013004/は,同じ耐性遺伝子遺伝子,AADA2とDFRA12を含んでいた。間隔-Q1-S1とCRISPR-Q4-S1の相同性プラスミドのPM5A24Pとそれらの配列は,菌と1012の両方に耐性を示した。間隔3-MEL-33プラスミドを,配列決定した。5つの配列は,菌 SF-SF2000102/において,同じ耐性遺伝子遺伝子,,を持ち,両方とも,毒性,,,VIRK,LDRB,,を持っていた。このプラスミドにはI-F型のCASシステムが存在する。結論:志賀の相同性プラスミドは,この菌株の薬剤耐性分布と類似している。CRISPRは赤痢菌の薬剤耐性と毒性に対して共調節を実現する可能性がある。そのため、最初の前間隔配列がCRISPR遺伝子座に統合され、新たな間隔配列を形成する過程において、赤痢菌は前の配列の外因性遺伝物質を携帯するその他の遺伝子断片、例えば薬剤耐性遺伝子と毒力遺伝子も赤痢菌ゲノムに統合され、その生存と性状に影響すると推測される。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *赤痢菌 ,  ゲノム ,  データベース ,  *相同性 ,  遺伝子 ,  *プラスミド ,  遺伝 ,  臨床分離菌 ,  *薬物耐性 ,  病原性 ,  スペーサ
準シソーラス用語： 耐性遺伝子 ,  薬物耐性遺伝子 ,  BLAST ,  CRISPR配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Shigella ,  CRISPR ,  spacer ,  drug resistance

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： CAS ,  配列相同性 ,  プラスミド ,  薬剤耐性 ,  赤痢菌