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J-GLOBAL ID：201702287583860162   整理番号：17A0350215

ILLUMINA 配列配列を用いて,ブロイラーの盲腸の微生物多様性を分析した。【JST・京大機械翻訳】

Diversity of the cecal microbiome of broiler chicken based on Illumina MiSeq sequencing platform

著者 (6件)： Lin Yicen (College of Veterinary Medicine,Animal Microecology Institute/Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province,Sichuan Agricultural University) ,  Xu Shuai (College of Veterinary Medicine,Animal Microecology Institute/Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province,Sichuan Agricultural University) ,  Ni Xueqin (College of Veterinary Medicine,Animal Microecology Institute/Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province,Sichuan Agricultural University) ,  Zeng Dong (College of Veterinary Medicine,Animal Microecology Institute/Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province,Sichuan Agricultural University) ,  Zhou Mengjia (College of Veterinary Medicine,Animal Microecology Institute/Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province,Sichuan Agricultural University) ,  Zeng Yan (College of Veterinary Medicine,Animal Microecology Institute/Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province,Sichuan Agricultural University)
資料名： Zhongguo Nongye Daxue Xuebao  (Zhongguo Nongye Daxue Xuebao)
巻： 21  号： 12  ページ： 65-73  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2277A  ISSN： 1007-4333  CODEN： ZNDXAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ブロイラーの盲腸微生物の多様性を探索するために,同じ条件下で15匹の科宝-500ブロイラーを選択し,ILLUMINA MISEQシークエンシングプラットフォームとQIIMEなど1616配列解析ツールを用いて22日齢で盲腸内容物を採取した。結果は以下を示した。1)配列分析により,359の158の有効配列と3のOTUが得られ,希釈曲線から,この配列決定結果がブロイラーの盲腸微生物群集を全面的にカバーすることを証明した。2)各試料群間に差があり,配列の数及び菌群多様性の差が大きかった。3)コア群集分析により、4つの共有菌群は門レベルでそれぞれ以下のことが分かった。それらは,門脈圧(70.0%±12.1%),門脈のFIRMICUTES(25.4%±11.2%),プロテオバクテリア門脈(4.3%±3.7%),および門脈圧(0.3%±0.5%)であった。4)有益な菌群は,LACTOBACILLUS 乳,LACTOBACILLUS BIFIDOBACTERIUM,BIFIDOBACTERIUM 盲腸が盲腸微生物に存在するが,相対的豊度は高くない。5)PICRUSTは盲腸の細菌群に対応する遺伝子機能を分析した。機能輸送、プリン代謝、DNA修復組換えタンパク質、酸化リン酸化とメタン代謝などの遺伝子機能の豊富度が最も高い。これらのことから,個体差はブロイラーの盲腸微生物構造に大きな影響を与えるものの,多くの共通性があることが示唆された。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA修復 ,  *微生物 ,  *ブロイラー ,  門脈 ,  個体差 ,  希釈 ,  *盲腸 ,  アルカン
準シソーラス用語： プリン代謝 ,  遺伝子機能 ,  プロテオバクテリア ,  門脈圧 ,  微生物コンソーシアム ,  盲腸内容物 ,  *微生物多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： chicken ,  cecal ,  microbiome ,  core microbiota ,  Illumina MiSeq sequencing ,  PICRUSt analysis

分類 (2件)： 腸  (EJ06040N) ,  鶏  (FD03020F)

物質索引 (1件)： メタン

タイトルに関連する用語 (4件)： ブロイラー ,  盲腸 ,  微生物多様性 ,  分析