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J-GLOBAL ID：201702287969883890   整理番号：17A0344921

オオクチバストランスクリプトームのSNPスクリーニングとそれらの成長との関連分析【JST・京大機械翻訳】

SNPS IDENTIFICATION IN RNA-SEQ DATA OF LARGEMOUTH BASS (MICROPTERUS SALMOIDES) FED ON FORMULATED FEED AND ASSOCIATION ANALYSIS WITH GROWTH TRAIT

著者 (6件)： Quan Yingchun (Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fish Application and Cultivation,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences) ,  Ma Dongmei (Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fish Application and Cultivation,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences) ,  Bai Junjie (Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fish Application and Cultivation,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences) ,  Liu Hao (Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fish Application and Cultivation,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences) ,  Li Shenjie (Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fish Application and Cultivation,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences) ,  Liu Haiyong (Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fish Application and Cultivation,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences)
資料名： Shuisheng Shengwu Xuebao  (Shuisheng Shengwu Xuebao)
巻： 40  号： 6  ページ： 1128-1134  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2164A  ISSN： 1000-3207  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では,人工飼料の代わりに冰鮮雑魚 養殖 オオクチバスの分子マーカーを開発するために,冰鮮魚 とと飼料を配合したコード オオクチバスを研究材料として使用した。RNA-SEQ(RNA SEQUENCING)技術を用いて、SNPS(SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)マーカーを発掘し、関連分析により育種に用いることができる候補標識を選別した。トランスクリプトームの配列決定により174 Mのデータを得,8681個のSNPSの遺伝子座を得た。その中に、発現差異のある50個のSNPS遺伝子座を選び、SNAPSHOT分類を行った結果、39個の分類が成功し、その中に4個が偽陽性となり、トランスクリプトーム技術によりSNPマーカー35個を開発し、成功率は70.0%であった。さらに,これらのマーカーがXun食の飼料を評価するために使用されるかどうかを調べるために,327の尾の摂食と人工飼料によるオオクチバスの試験を行い,SPSSソフトウェアを用いて,異なる遺伝子型と成長形質の相関を分析した。結果は,2つのSNP座が体重,全長,および高さのような成長形質と有意に相関していることを示し(P<0.05),それはオオクチバスの分子マーカーとして使用することができた。トランスクリプトームデータの直接反応遺伝子の発現状況により、その中から性状に関連する優性遺伝子型と分子マーカーの成功率は高く、効果は比較的に良い。同時に、大口のLu選育の研究におけるマーカー欠乏の解決に有効な手段を提供し、遺伝的根拠を提供し、育種のプロセスを加速させる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *オオクチバス ,  遺伝 ,  遺伝子型 ,  RNA【核酸】 ,  *スクリーニング ,  遺伝子 ,  育種 ,  *トランスクリプトーム ,  人工飼料 ,  体重 ,  養殖
準シソーラス用語： 優性遺伝子 ,  成功率 ,  SNPマーカー ,  分子マーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： RNA sequencing (RNA-Seq) ,  Largemouth bass ,  Single nucleotide polymorphisms (SNPs) ,  Growth trait

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： SNP ,  スクリーニング ,  成長 ,  分析