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J-GLOBAL ID：201702288858049045   整理番号：17A0024117

新しい縞状2ヒット法によるヌクレオチド塩基性局所アラインメント探索ツールのための特殊プロセッサの設計【Powered by NICT】

A special processor design for Nucleotide Basic Local Alignment Search Tool with a new Banded two-hit method

著者 (5件)： Chang Chih-Yu (Department of Electrical Engineering and Graduate Institute of Electronics Engineering, National Taiwan University, Taipei, Taiwan, 10617) ,  Li Yu-Cheng (Department of Electrical Engineering and Graduate Institute of Electronics Engineering, National Taiwan University, Taipei, Taiwan, 10617) ,  Chen Nae-Chyun (Department of Electrical Engineering and Graduate Institute of Electronics Engineering, National Taiwan University, Taipei, Taiwan, 10617) ,  Huang Xiao-Xuan (Department of Electrical Engineering and Graduate Institute of Electronics Engineering, National Taiwan University, Taipei, Taiwan, 10617) ,  Lu Yi-Chang (Department of Electrical Engineering and Graduate Institute of Electronics Engineering, National Taiwan University, Taipei, Taiwan, 10617)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2016  号： NORCAS  ページ： 1-5  発行年： 2016年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Tradditionally,配列アラインメントは,ソフトウェアにより行った。本論文では,新しい縞状二ヒット法によるヌクレオチド(BLASTn)のためのBasic Local Alignment Search Toolに基づく専用プロセッサを設計した。ギャップのないBLASTnソフトウェア,NCBI v2.2.31+から得られた結果と比較した場合,ハードウェアは常に等しいか良好な整列結果と共に2~6倍スピードアップと370mWの電力消費を示した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 高速化 ,  *アラインメント ,  専用プロセッサ ,  電力消費 ,  *演算プロセッサ ,  *ヌクレオチド ,  ハードウェア ,  *塩基性 ,  ソフトウェア
準シソーラス用語： NCBI ,  配列アライメント , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 信号理論  (ND02020G)

タイトルに関連する用語 (7件)： 縞 ,  ヌクレオチド塩基 ,  アラインメント ,  探索 ,  ツール ,  プロセッサ ,  設計