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J-GLOBAL ID：201702289000646771   整理番号：17A0075585

リアルタイム蛍光定量的PCRによる内部遺伝子のスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

The Selection of Reference Genes for Quantitative PCR in Betula luminifera

著者 (6件)： Liu Wenzhe (The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture Zhejiang A & F University) ,  Niu Mingyue (The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture Zhejiang A & F University) ,  Li Xiuyun (The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture Zhejiang A & F University) ,  Lin Erpei (The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture Zhejiang A & F University) ,  Huang Huahong (The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture Zhejiang A & F University) ,  Tong Zaikang (The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture Zhejiang A & F University)
資料名： Linye Kexue  (Linye Kexue)
巻： 52  号： 8  ページ： 29-37  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2424A  ISSN： 1001-7488  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】定量的PCRと発現分析ソフトウェアを用いて,LUMINIFERAの異なる組織における候補遺伝子の発現安定性を研究し,LUMINIFERAの定量的PCRのための安定した参照遺伝子を得るために,標的遺伝子の発現解析によってそれらの信頼性を検証した。【方法】16の一般遺伝子を候補遺伝子として選択し,プライマーを設計し,一般的PCR,溶解曲線およびアガロースゲル電気泳動によって特異性を確認した。LUMINIFERA16の異なる組織における候補遺伝子の発現安定性を,リアルタイム蛍光定量的PCRおよびソフトウェアGENORM,,およびBESTKEEPERによって分析し,そして,最適化された遺伝子および組合せを分析した。さらに,2つの標的遺伝子遺伝子とKORにより,参照遺伝子の安定性を検証した。[結果]PCRと電気泳動の結果により、候補遺伝子のPCRの目的フラグメントのバンドははっきりし、融解曲線も明らかな単一ピークを示し、これらのプライマーの特異性は良好であることが分かった。特異的プライマーを用いて、16個の異なる組織におけるこれらの候補遺伝子の発現を分析し、18Sを除いて、その他の遺伝子のCT値はいずれも25~30の間に集中していることが分かった。NORMFINDERとBESTKEEPER分析の結果,EF1Αの安定性が最も高く,GENORMが最も安定しており,UBI-LPがすべての候補遺伝子の中で最も安定していることが示された。さらに,3つの安定した発現候補遺伝子(EF1Α,TATAおよびと4)および安定性の悪いUBI-LPを,参照遺伝子として選択し,2つの標的遺伝子遺伝子およびKORの相対的発現を分析した。その結果,これら2つの標的遺伝子は3つの安定した参照遺伝子に対して一致した相対的発現量を示したが,不安定な内部遺伝子LP/LP-LPは発現データを効率的に標準化することができず,結果として有意な差があった。【結論】リアルタイム蛍光定量的PCRおよび包括的3種のソフトウェア解析の結果,LUMINIFERAの異なる組織において,EF1Α,TATAおよびUBI4遺伝子の発現安定性が高く,これら3つの遺伝子を検証し,リアルタイム蛍光定量的PCRの内部標準としての信頼性を明らかにした。そのため、EF1Α、TATAとUBI4は研究遺伝子として、BETULA LUMINIFERAの異なる組織器官に発現する安定した参考菌とすることができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *スクリーニング ,  電気泳動 ,  *定量的PCR法 ,  標準化 ,  ソフトウェア ,  *遺伝子 ,  最適化 ,  *蛍光
準シソーラス用語： 融解曲線 ,  特異性 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  標的遺伝子 ,  参照遺伝子 ,  候補遺伝子 ,  *実時間 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Betula luminifera ,  reference gene ,  real-time quantitative PCR

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (5件)： リアルタイム ,  蛍光 ,  定量的PCR ,  遺伝子 ,  スクリーニング