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J-GLOBAL ID：201702291959754462   整理番号：17A0324324

トランスクリプトーム及びプロテオーム分析はハクサイにおける低温誘導葉頭部形成の調節機構への新たな洞察を提供する【Powered by NICT】

Transcriptomic and proteomic analyses provide new insights into the regulation mechanism of low-temperature-induced leafy head formation in Chinese cabbage

著者 (8件)： Zhang Chang-wei (State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in East China, Ministry of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, PR China) ,  Wei Yan-ping (State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in East China, Ministry of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, PR China) ,  Xiao Dong (State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in East China, Ministry of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, PR China) ,  Gao Li-wei (State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in East China, Ministry of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, PR China) ,  Lyu Shan-wu (State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in East China, Ministry of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, PR China) ,  Hou Xi-lin (State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Key Laboratory of Biology and Germplasm Enhancement of Horticultural Crops in East China, Ministry of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, PR China) ,  Hou Xi-lin (Jiangsu Polytechnic College of Agriculture and Forestry, Engineering and Technology Center for Modern Horticulture, Zhenjiang, Jiangsu 212400, PR China) ,  Bouuema Guusje (Laboratory of Plant Breeding, Wageningen University, Wageningen 6700AJ, the Netherlands)
資料名： Journal of Proteomics  (Journal of Proteomics)
巻： 144  ページ： 1-10  発行年： 2016年 
JST資料番号： T0073A  ISSN： 1874-3919  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ハクサイでは,葉頭部形質であるキャベツ収量と市場性,種鶏に主に関与しているターゲットをしばしばに直接関係している。集中研究は過去10年間で中国キャベツの結球観測を実施しているが,トランスクリプトームとプロテオームの展望で低温度の影響下での頭部形成に関与する機構で入手可能な非常に乏しい情報。本研究では,RNA-SeqトランスクリプトームとiTRAQプロテオームに基づく定量的発現プロファイリングを組み合わせて,分子動力学の全体像のためのこの特性を調べた。2931転写物と365--蛋白質の全はハクサイを出穂と非芯摘みから豊度で有意に変化したレベルで同定した。機能アノテーション,階層的カテゴリーと同様に,転写産物への蛋白質から相関を含む関連解析を行った。結果はハクサイの葉の頭部形成は複雑な調節パターンを含んでいることを示した。植物ホルモンシグナル伝達の経路にマッピングされたことを相関遺伝子は頭部形成は様々な植物ホルモンの総括的結果であることを示唆した。我々の総合的分析はハクサイの葉頭部形成の調節機構を理解するための包括的アプローチを提供するであろう。本研究は植物の収率で葉出穂形質の直接関係を明らかにした。ハクサイの頭部形成に関与する分子機構に関する更なる研究のための重要な情報を提供するためにトランスクリプトームとプロテオームの定量的発現プロファイリング解析を統合して行った包括的研究。豊度における転写産物への蛋白質の相関はハクサイの葉頭部形成に影響を及ぼす転写後因子の関与のいくつかの必要な情報を提供するかもしれない。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： キャベツ ,  *プロテオーム ,  タンパク質 ,  植物ホルモン ,  *ハクサイ ,  アノテーション ,  *低温 ,  *トランスクリプトーム ,  分子動力学
準シソーラス用語： 分子機構 ,  出穂 ,  関連解析 ,  転写産物 ,  プロファイリング ,  iTRAQ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ハクサイ ,  葉ヘッド ,  トランスクリプトーム ,  プロテオーム ,  相関

分類 (3件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (10件)： トランスクリプトーム ,  プロテオーム ,  分析 ,  ハクサイ ,  低温 ,  誘導 ,  葉 ,  頭部 ,  調節 ,  洞察