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J-GLOBAL ID：201802210998048219   整理番号：18A0467488

ゲノムワイド個体群構造と混合解析はウガンダのヤギ品種間の弱い分化を明らかにする【Powered by NICT】

Genome-wide population structure and admixture analysis reveals weak differentiation among Ugandan goat breeds

著者 (8件)： Onzima R. B. (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, P O Box 338, 6700AH, Wageningen, The Netherlands) ,  Onzima R. B. (National Agricultural Research Organization (NARO), P O Box 295, Entebbe, Uganda) ,  Upadhyay M. R. (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, P O Box 338, 6700AH, Wageningen, The Netherlands) ,  Upadhyay M. R. (Department of Animal Breeding and Genetics, Swedish University of Agricultural Sciences, Uppsala, Sweden) ,  Mukiibi R. (Department of Agriculture, Food and Nutritional Sciences (AFNS), Faculty of Agriculture, Life and Environmental Sciences, University of Alberta, 1416 College Plaza Edmonton, T6G 2C8, Alberta, Canada) ,  Kanis E. (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, P O Box 338, 6700AH, Wageningen, The Netherlands) ,  Groenen M. A. M. (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, P O Box 338, 6700AH, Wageningen, The Netherlands) ,  Crooijmans R. P. M. A. (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, P O Box 338, 6700AH, Wageningen, The Netherlands)
資料名： Animal Genetics  (Animal Genetics)
巻： 49  号： 1  ページ： 59-70  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0281A  ISSN： 0268-9146  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウガンダは,主に多様な生産システムで飼育された固有種から,ヤギの大規模集団外来Boerヤギとの交雑育種により脅かされているその存在を有していた。これらウガンダのヤギ品種間の遺伝的特性と関係とBoerヤギの潜在的混和材についての知識はまだ限られている。中密度一塩基多型(SNP)パネルを用いて,遺伝的多様性,ウガンダの六種のヤギ品種における個体群構造と混合を評価した:Boer,Karamojong,Kigezi,Mubende,スモールイーストアフリカンおよびSebei。全ての動物は品質管理後約46105SNPの遺伝子型を有していた。0.885(Kigezi)~0.928多型SNPの高比率を見出した(Sebei)。品種間の全体的な平均観測(H_O)と期待される(H_E)異型接合性はそれぞれ0.355±0.147および0.384±0.143であった。主成分,遺伝的距離と混合分析は品種間で部分構造法弱い集団を明らかにした。主成分は他の土着ヤギからKigeziと弱Small East Africanを分離した。SebeiとKaramojongは密に絡み合ったたが,Mubendeは他の全ての在来種からの高混合より中心的位置を占めていた。Boer品種はウガンダの固有ヤギ品種からのユニークなクラスタを示した。結果は共通の祖先でなく地理的分化のいくつかのレベルを反映している。混合とf_4統計は品種間の遺伝的混合のBoerと様々なレベルからの遺伝子流を明らかにした。一般,高レベルの遺伝的多様性の中程度から観察された。著者らの知見は,遺伝的多様性を維持し,交雑育種計画における品種内多様性とヘテロ接合体の利点を利用するために適切な育種プログラムの設計に有用な洞察を提供した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 一塩基多型 ,  集団遺伝 ,  *品種 ,  クラスタ ,  生物多様性 ,  遺伝子型 ,  *ウガンダ共和国 ,  交雑育種 ,  遺伝 ,  在来種
準シソーラス用語： 遺伝子流動 ,  遺伝距離 ,  ヘテロ接合性 ,  遺伝多様性 ,  *個体群構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 品種構成 ,  品種多様性 ,  Capra hircus ,  ヘテロ接合性 ,  土着ヤギ ,  集団遺伝学

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  羊,山羊  (FD02050F)

タイトルに関連する用語 (7件)： ゲノム ,  個体群構造 ,  解析 ,  ウガンダ ,  ヤギ ,  品種 ,  分化