二階堂愛

ニカイドウイトシ | NIKAIDO Itoshi

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (2件)：

ホームページURL (1件)： https://www.hackingisbelieving.org/

研究分野 (3件)：ゲノム生物学 , 生命、健康、医療情報学 , システムゲノム科学

研究キーワード (14件)：シングルセル , データサイエンス , ゲノムインフォマティクス , トランスクリプトーム , オミクス , ゲノミクス , RNA , バイオインフォマティクス , ChIP-Seq , 1細胞 , RNA-Seq , 次世代DNAシーケンサー , ゲノム , 遺伝子

競争的資金等の研究課題 (15件)：

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論文 (58件)：

Hinako M. Takase, Tappei Mishina, Tetsutaro Hayashi, Mika Yoshimura, Mariko Kuse, Itoshi Nikaido, Tomoya S. Kitajima. Transcriptomic signatures of WNT-driven pathways and granulosa cell-oocyte interactions during primordial follicle activation. PLOS ONE. 2024
Koki Tsuyuzaki, Manabu Ishii, Itoshi Nikaido. Sctensor detects many-to-many cell-cell interactions from single cell RNA-sequencing data. BMC bioinformatics. 2023. 24. 1. 420-420
Yasuyuki Shima, Henrik Skibbe, Yohei Sasagawa, Noriko Fujimori, Yoshimi Iwayama, Ayako Isomura-Matoba, Minoru Yano, Takumi Ichikawa, Itoshi Nikaido, Nobutaka Hattori, et al. Distinctiveness and continuity in transcriptome and connectivity in the anterior-posterior axis of the paraventricular nucleus of the thalamus. Cell reports. 2023. 42. 10. 113309-113309
Hitomi Takada, Yohei Sasagawa, Mika Yoshimura, Kaori Tanaka, Yoshimi Iwayama, Tetsutaro Hayashi, Ayako Isomura-Matoba, Itoshi Nikaido, Akira Kurisaki. Author Correction: Single-cell transcriptomics uncovers EGFR signaling-mediated gastric progenitor cell differentiation in stomach homeostasis. Nature Communications. 2023
Nao Ogura, Yohei Sasagawa, Tasuku Ito, Toshiaki Tameshige, Satomi Kawai, Masaki Sano, Yuki Doll, Akira Iwase, Ayako Kawamura, Takamasa Suzuki, et al. WUSCHEL-RELATED HOMEOBOX 13 suppresses de novo shoot regeneration via cell fate control of pluripotent callus. Science Advances. 2023. 9. 27

MISC (83件)：

二階堂愛, 二階堂愛. 超多検体オミクスによる細胞特性の計測. 日本再生医療学会総会(Web). 2021. 20th
二階堂愛, 二階堂愛. 1細胞トランスクリプトームデータの解析技術. 医学のあゆみ. 2021. 276. 10
二階堂愛. ヒト細胞アトラス構築のための1細胞トランスクリプトーム技術. 日本臨床免疫学会総会プログラム・抄録集. 2020. 48回. 82-82
笹川洋平, 田中かおり, 林哲太郎, 二階堂愛. 1細胞RNA解析で世界最高成績 -国際的な性能比較研究で証明-. 2020
森田梨津子, 三千典子, 佐々木弘子, 林哲太郎, 梅田茉奈, 芳村美佳, 山本尚貴, 柴田達夫, 阿部高也, 清成寛, et al. 毛包幹細胞の発生起源と誘導過程. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd

特許 (4件)：

書籍 (12件)：

空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド〜最新機器の特徴と目的に合った選び方、データ解析と応用例を学び、シングルセル解析の一歩その先へ! (実験医学別冊最強のステップUPシリーズ)
羊土社 2022 ISBN:475812261X
実験医学別冊新世代フローサイトメトリー活用スタンダード
羊土社 2021
シングルセル解析でなにがわかるか
化学同人 2020 ISBN:9784759817348
定量生物学 : 生命現象を定量的に理解するために
化学同人 2018 ISBN:9784759817300
新版フローサイトメトリーもっと幅広く使いこなせる! 〜マルチカラー解析も、ソーティングも、もう悩まない! (実験医学別冊最強のステップUPシリーズ)
羊土社 2016 ISBN:4758101965

講演・口頭発表等 (119件)：

Leveraging Large-Scale Generative AI for Omics with High-Throughput Transcriptome Analysis
(The 69th Annual Meeting of the Japan Society of Human Genetics. 2024)
AIの手引きで実践するシングルセルRNAシーケンスデータ解析
(2024年度日本実験動物学会総会 2024)
大規模生成AIとゲノム科学による創薬を目指して
(日本薬学会第144年会 2024)
大規模生成AIと大規模トランスクリプトームデータによる遺伝子発現変動の予測
(第47回日本分子生物学会年会 2024)
バイオインフォマティクスとゲノム科学で挑む生命の理解
(理化学研究所生命機能科学研究センター発生・再生科学集中レクチャープログラム 2023)

学歴 (1件)：

学位 (1件)：

経歴 (14件)：

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委員歴 (7件)：

2023/11 - 現在公益財団法人細胞科学研究財団研究助成審査委員
2018/10 - 現在国立研究開発法人科学技術振興機構(JST) CREST・さきがけ複合研究領域 ”ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出” 領域アドバイザー
2018 - 現在情報・システム研究機構国立遺伝学研究所 DNAデータ研究利用委員会
2017 - 現在国立研究開発法人科学技術振興機構(JST) バイオサイエンスデータベースセンター基盤技術分科会委員
2023/01 - 2024/12 特定非営利活動法人日本分子生物学会研究倫理委員会

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所属学会 (5件)：

一般社団法人ゲノムテクノロジー研究会 , 日本再生医療学会 , 定量生物の会 , bioinformatics-jp , 日本分子生物学会

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

二階堂 愛