坂田克己

サカタカツミ | Sakata Katsumi

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

ホームページURL (1件)： https://www.acoffice.jp/mithp/KgApp?resId=S000036

研究分野 (3件)：数理物理、物性基礎 , 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 , 生命、健康、医療情報学

研究キーワード (3件)：生命情報 , 生命現象の物理 , 数理モデル

競争的資金等の研究課題 (3件)：

論文 (72件)：

Katsumi Sakata, Toshiyuki Saito, Hajime Ohyanagi, Ramesh Katam, Setsuko Komatsu. An information-theoretic model suggesting genetic regulatory system degradation under climate change. Physics Open. 2021. 6
Katsumi Sakata, Ramesh Katam, Toshiyuki Saito, Hajime Ohyanagi, Setsuko Komatsu. An Information-Theoretic Model for Managing Predator-Prey Ecosystems Facing Climate Changes. International Journal on Advances in Life Sciences. 2020. 12. 10-15
Katam R, Shokri S, Murthy N, Singh SK, Suravajhala P, Khan MN, Bahmani M, Sakata K, Reddy KR. Proteomics, physiological, and biochemical analysis of cross tolerance mechanisms in response to heat and water stresses in soybean. PLOS ONE. 2020
Xin Wang, Katsumi Sakata, Setsuko Komatsu. An integrated approach of proteomics and computational genetic modification effectiveness analysis to uncover the mechanisms of flood tolerance in soybeans. International Journal of Molecular Sciences. 2018. 19. 5
Setsuko Komatsu, Xin Wang, Xiaojian Yin, Yohei Nanjo, Hajime Ohyanagi, Katsumi Sakata. Integration of gel-based and gel-free proteomic data for functional analysis of proteins through Soybean Proteome Database. JOURNAL OF PROTEOMICS. 2017. 163. 52-66

MISC (41件)：

小松節子, 坂田克己, 中村卓司, MUSTAFA Gazara. ダイズ代謝系シミュレイションモデルは耐湿性関連遺伝子の絞り込みに有効である. 農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web). 2016. 2016
小松節子, 中村卓司, 中山則和, 平賀勧, 山本亮, 島村聡, 南條洋平, 大柳一, 坂田克己. ダイズプロテオームデータベースは湿害関連タンパク質の検出に有用である. 農研機構作物研究所成果情報(Web). 2008. 2008
南條洋平, 山本亮, 橋口晶子, 島村聡, 中村卓司, 三上陽司, 湯野川春信, 坂田克己, 小松節子. ダイズ出芽時の冠水処理により変動する遺伝子群のトランスクリプトーム解析. 生化学. 2008. 4P-1249
坂田克己, 伊川浩司, 渡辺博之, 芦川育夫, 清水裕司, 堀内郁雄, ANTONIO Baltazar A, 沼寿隆, 長村吉晃, 松本隆. イネゲノム情報を基盤としたアノテーションシステム(RiceGAAS/GFSelector):遺伝子オントロジー自動解析を含む機能拡充. 生化学. 2007. 2P-1381
昇博也, 小松節子, 三井重之, 西林双龍, 長村吉晃, 渡辺克昭, アントニオバルタザールオ, 坂田克己. 植物遺伝子の発現ネットワーク推定法. 情報処理学会研究報告数理モデル化と問題解決(MPS). 2006. 2006. 135. 143-147

書籍 (3件)：

Plant proteomics: from genome sequencing to proteome databases and repositories.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1072 29-42 2014
Advances in proteomics research for peanut genetics and breeding in peanut. In Mallikarjuna N. et al. eds. Genetics, genomics and breeding of peanuts.
CRC Press, Florida 2014
Mining knowledge from omics data. In Kishor P.B.K. et al. eds. Agricultural bioinformatics.
Springer, New York 2014

講演・口頭発表等 (119件)：

冠水下のダイズの生長に及ぼす植物由来煙水の影響の大規模オミクス解析-代謝マップ上への画像情報処理の融合
(第42回日本分子生物学会年会(1P-0056) 2019)
ストレス下のダイズのオミクス統合ネットワークから展開する技術
(日本プロテオーム学会2019年大会 2019)
A Mathematical Model for Predator-Prey Ecosystems Facing Climate Changes
(BIOTECHNO 2019 : The Eleventh International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies (awarded) 2019)
気候変動下の捕食者-被食者生態系の数理モデル構築とシミュレーション
(日本応用数理学会 2019年研究部会連合発表会 2019)
ヒト転写とダイズ代謝反応の外部刺激に対する応答-デジタル物理学的モデルによる一般化
(第41回日本分子生物学会年会 2018)

学歴 (2件)：

学位 (1件)：

所属学会 (5件)：

日本応用数理学会 , 日本分子生物学会 , Editorial Board in Symmetry (MDPI) , Editorial Board in International Journal for Computational Biology , 日本生物物理学会

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坂田 克己