有田正規

Arita Masanori

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： http://metabolomics.jp

研究分野 (3件)：ゲノム生物学 , 生命、健康、医療情報学 , 生物分子化学

研究キーワード (13件)：生合成 , 物質生産 , 二次代謝 , アントシアニン , アルカロイド , データベース , 脂質 , ネットワーク , 質量分析 , フラボノイド , メタボロミクス , 代謝 , メタボローム

競争的資金等の研究課題 (16件)：

2015 - 2023 「リポクオリティ」領域研究の国際連携
2020 - 2023 超高感度ウイルス計測に基づく感染症対策データ基盤
2017 - 2021 乳酸菌とビフィズス菌の基準ゲノム作成と公開
2017 - 2021 代謝物理論マススペクトルライブラリの構築と普及
2015 - 2020 脂肪酸クオリティの最先端リピドミクスと生理的意義の解明

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論文 (16件)：

Kaisa Thorell, Zilia Y. Muñoz-Ramírez, Difei Wang, Santiago Sandoval-Motta, Rajiv Boscolo Agostini, Silvia Ghirotto, Roberto C. Torres, Judith Romero-Gallo, Uma Krishna, Richard M. Peek, et al. The Helicobacter pylori Genome Project: insights into H. pylori population structure from analysis of a worldwide collection of complete genomes. Nature Communications. 2023. 14. 1
Ruth E Timme, Ilene Karsch-Mizrachi, Zahra Waheed, Masanori Arita, Duncan MacCannell, Finlay Maguire, Robert Petit Iii, Andrew J Page, Catarina Inês Mendes, Muhammad Ibtisam Nasar, et al. Putting everything in its place: using the INSDC compliant Pathogen Data Object Model to better structure genomic data submitted for public health applications. Microbial genomics. 2023. 9. 12
So Nakagawa, Toshiaki Katayama, Lihua Jin, Jiaqi Wu, Kirill Kryukov, Rise Oyachi, Junko S Takeuchi, Takatomo Fujisawa, Satomi Asano, Momoka Komatsu, et al. SARS-CoV-2 HaploGraph: visualization of SARS-CoV-2 haplotype spread in Japan. Genes & genetic systems. 2023. 98. 5. 221-237
Takeshi Ara, Yuichi Kodama, Toshiaki Tokimatsu, Asami Fukuda, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata. Nucleic acids research. 2023
Shizuka Koshimizu, Sachiko Masuda, Arisa Shibata, Takayoshi Ishii, Ken Shirasu, Atsushi Hoshino, Masanori Arita. Genome and transcriptome analyses reveal genes involved in the formation of fine ridges on petal epidermal cells in Hibiscus trionum. DNA Research. 2023. 30. 5

MISC (14件)：

藤澤貴智, 小笠原理, 中村保一, 有田正規. DDBJサービスの統合化を目指して. トーゴーの日2022. 2022. 1
有田正規, 有田正規, 遠藤明仁, 多田一風太, 谷沢靖洋, 遠野雅徳. データベースから発見されたガセリ菌のサブグループ In silico手法によるガセリ菌発見. 化学と生物. 2018. 56. 7
有田正規. 学会誌をどう出版するか : 商業出版社に託す場合の注意点. 情報管理. 2016. 59. 6. 377-383
谷沢靖洋, 谷沢靖洋, 藤澤貴智, 神沼英里, 中村保一, 有田正規. 乳酸菌に特化したゲノムアーカイブDAGAおよびアノテーションパイプラインDFASTの構築. 日本乳酸菌学会誌. 2016. 27. 2
谷澤靖洋, 谷澤靖洋, 藤澤貴智, 神沼英里, 中村保一, 有田正規, 有田正規. 乳酸菌に特化したゲノムアーカイブおよびアノテーションパイプラインの構築. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2016. 10th

書籍 (2件)：

学術出版の来た道
岩波書店 2021 ISBN:9784000297073
科学の困ったウラ事情 (岩波科学ライブラリー)
岩波書店 2016 ISBN:4000296477

講演・口頭発表等 (24件)：

Sequencing Technologies and the Conservation of Biological Diversity
(Asian Regional Conference on Systems BIology 2023)
Issues of Digital Sequence Information (DSI) emerged from the COVID-19 pandemic
(DSWS2023 (Session 3: Lessons learned from COVID-19 data) 2023)
Convention on Biological Diversity (CBD) and Open Science
(DSWS2023 (public lectures) 2023)
話題提供
(MBSJ-EMBO合同企画ランチョンセミナー「あなたの論文はどこへ行く:論文出版とオープンサイエンスに関する対話」 2023)
脂質データベースの構築と公開情報の重要性
(第20回日本糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム(JCGG) 2023)

学位 (1件)：

博士(理学) (東京大学)

経歴 (8件)：

2018/04 - 現在情報・システム研究機構国立遺伝学研究所生命情報・DDBJセンター長
2013/11 - 現在情報・システム研究機構国立遺伝学研究所教授
2013/04 - 現在特定国立研究開発法人理化学研究所環境資源科学研究センターチームリーダー
2010/04 - 2013/10 東京大学理学系研究科生物化学専攻准教授
2006/11 - 2013/03 理化学研究所植物科学研究センター副グループディレクター

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委員歴 (2件)：

2017/10 - 現在日本学術会議 24期バイオインフォマティクス分科会委員長
2014/10 - 現在日本学術会議連携会員(23期-)

所属学会 (5件)：

米国化学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 日本脂質生化学会 , 日本農芸化学会 , 日本バイオテクノロジー学会

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