清水啓史

シミズヒロフミ | SHIMIZU Hirofumi

所属機関・部署：
職名：講師
ホームページURL (1件)： http://seiri2.med.lab.u-fukui.ac.jp/

研究分野 (3件)：医療薬学 , 生理学 , 生物物理学

研究キーワード (8件)： KcsA カリウムイオンチャネル , 1分子動態計測 , QT延長症候群,カリウムチャネル , long QT syndrome,potassium channel(HERG) , 生理学 , 生物物理学 , Physiology , Biophysics

競争的資金等の研究課題 (29件)：

2023 - 2026 X線1分子動態計測による膜蛋白質マルチセンシング機構の動的解明
2022 - 2025 蛋白質の立体構造にタイムスタンプを付し構造遷移過程の全容を解明する手法の確立
2021 - 2024 カリウムチャネルKcsAの脂質内高分解能構造解析によるゲーティング機構の解明
2019 - 2021 蛋白質の立体構造にタイムスタンプを付し構造遷移過程を解明する手法開発
2019 - 2021 熱エネルギーを電気エネルギーに変換する分子機構の動的解明

2018 - 2021 膜電位存在下におけるイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測

2018 - 2020 X線1分子動態計測による温度依存性イオンチャネル開閉制御機構の動的解明

2017 - 2019 in vitro とin cellの蛋白質動態をつなぐX線1分子動態計測法の開発

2015 - 2018 膜電位存在下におけるイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測

2015 - 2017 in vitro とin cellの蛋白質動態をつなぐX線1分子動態計測法の開発

2015 - 2017 蛋白質の1分子動態計測法に最適化した半導体X線検出器の開発

2013 - 2015 半導体ナノ加工技術を利用したX線1分子動態計測法の開発

2012 - 2015 膜電位存在下におけるイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測

2011 - 2014 KcsAカリウムチャネルpH依存性ゲーティングダイナミクスの一分子構造機能解析

2010 - 2011 エックス線1分子計測によるイオンチャネル開閉ダイナミクスの解析

2010 - 2011 エックス線1分子計測によるイオンチャネル準安定状態の観測

2008 - 2011 電場と動態:膜電位存在下でのイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測

2008 - 2010 イオンチャネルの構造-機能ダイナミクス:ゲーティング構造変化の単一分子解析

2008 - 2009 エックス線1分子計測によるイオンチャネル開閉ダイナミクスの解析

2008 - 2008 エックス線分子生理学:イオンチャネル1分子電流と1分子構造変化の同時計測

2005 - 2006 フェムトアンペアレベルの単一チャネルノイズ解析のための統合的方法論の確立

2003 - 2004 膜タンパク質二次元結晶の電気的特性とその成長過程の長時間追跡法の開発

2001 - 2002 膜蛋白質3次元結晶の電気特性測定法の開発

2001 - 2002 チャネル分子立体構造-機能相関研究のための大腸菌機能発現プラットフォームの開発

カリウムイオンチャネルの機能・ダイナミクス同時計測

QT延長症候群に関与する心臓Kチャネルの機能解析

Functional Analysis of HERG.(human k channel)

Relationships between dynamics and function of potassium channels in a single molecular level

Functional Analysis of HERG.(human k channel)

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論文 (43件)：

清水啓史. 1分子動態・構造解析による新しい K+チャネルゲーティングモデルの提案. 生理研研究会. 2022
清水啓史. X線1分子動態計測法の開発. 第67回中部日本生理学会. 2020
清水啓史. イオンチャネル構造遷移過程のX線1分子動画計測. 生理研研究会. 2020
Shimizu H, Kobayashi T, Iwamoto M, Kajiwara K, Kurebayashi N, Ogawa H, Murayama T. Single-molecule fluctuations and conformational changes of the human transient recepror potential vanilloid 1 (TRPV1) channel recorded using diffracted X-ray tracking. The Journal of Physiological Sciences. 2020. 70. suppl. s118-s118
Hirofumi Shimizu. Diffracted X-ray tracking method for recording single-molecule protein motions. Biochimica et biophysica acta. General subjects. 2020. 1864. 2. 129361-129361

MISC (40件)：

Hirofumi Shimizu, Takuya Kobayashi, Masayuki Iwamoto, Kentaro Kajiwara, Nagomi Kurebayashi, Haruo Ogawa, Takashi Murayama. Single-Molecule Twisting Motions During Gating of the Human TRPV1 Channel Recorded with Sub-Millisecond Time Resolution. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2020. 118. 3. 22A-22A
清水啓史, 田渕友樹, 田原樹生, 岩本真幸, 平井義和, 土屋智由, 田畑修. 低X線散乱ノイズ観測チャンバー開発による蛋白質1分子構造変化計測. 「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編]. 2017. 34. 1-4
Hiroyuki Nakao, Keisuke Ikeda, Masayuki Iwamoto, Hirofumi Shimizu, Shigetoshi Oiki, Yasushi Ishihama, Minoru Nakano. PH-dependent promotion of phospholipid flip-flop by the KcsA potassium channel. Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes. 2015. 1848. 1. 145-150
H. Shimizu, M. Iwamoto, Y. Oota, Yoshikazu Hirai, Osamu Tabata, S. Oiki. The diffracted X-ray tracking method for recording the single-molecule conformational changes of the KcsA potassium channel in a sub-millisecond time resolution. The 45th Natl Inst Physiol Sci (NIPS) International Symposium. 2014. 22
中尾裕之, 若林真樹, 池田恵介, 石濱泰, 岩本真幸, 清水啓史, 老木成稔, 中野実. カリウムチャネルKcsAのpH依存的なリン脂質flip-flop誘起能. 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM). 2014. 134th. 2. ROMBUNNO.28Q-AM03S-260

講演・口頭発表等 (89件)：

Microfluidic-based Diffracted X-ray Tracking Method for Real-Time Observation of Ion Channel Twist Motion Under Sequential Chemical Stimuli
(The 22nd International Conference on Solid-State Sensors Actuators and Microsystems (Transducers 2023) 2023)
pH変化に対するKcsAイオンチャネルの運動応答を解析するためのX線1分子動態計測用流体デバイス
(化学とマイクロ・ナノシステム学会第47回研究会 2023)
A new gating model of K+ channel based on cryo-EM structures and single-molecule dynamics measurements using X-ray
(日本生理学会第100回記念大会 2023)
Structural Basis for pH-gating of the K+ channel KcsA
(日本顕微鏡学会シンポジウム 2022)
ナノディスクに挿入したカリウムチャネルKcsAの構造
(第60回日本生物物理学会 2022)

Works (10件)：

膜電位存在下におけるイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測, 基盤研究(A)(一般)
2014 -
半導体ナノ加工技術を利用したX線1分子動態計測法の開発, 挑戦的萌芽研究
2014 -
KcsAカリウムチャネルpH依存性ゲーティングダイナミクスの一分子構造機能解析, 基盤研究(B)(一般)
2013 -
エックス線1分子計測によるイオンチャネル開閉ダイナミクスの解析, 特定領域研究(継続領域)
2011 -
電場と動態:膜電位存在下でのイオンチャネルの機能と構造変化の1分子同時計測, 若手研究(S)
2011 -

学歴 (2件)：

- 2000 東京大学理学系研究科生物化学
- 2000 東京大学

学位 (1件)：

博士(理学) (東京大学)

委員歴 (4件)：

2003 - アメリカ生物物理学会一般会員
2001 - 生理学会一般会員
1996 - 生物物理学会一般会員
1996 - 生物物理学会 member

受賞 (3件)：

2012 - 医学系研究奨励対象
2010 - 文部科学大臣表彰若手科学者賞
2010 - The Young Scientists’ Prize, The Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology

所属学会 (4件)：

生物物理学会 , 生理学会 , アメリカ生物物理学会 , 生物物理学会

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

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