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J-GLOBAL ID：201702213135218667   整理番号：17A0748519

ゲノムマイニングに基づくActinokineospora spheciospongiaeからの新しい抗菌性ペプチドactinokineosinの単離【Powered by NICT】

Isolation of a new antibacterial peptide actinokineosin from Actinokineospora spheciospongiae based on genome mining

著者 (6件)： Takasaka N. (Graduate School of Integrated Science and Technology, Shizuoka University, Suruga-ku, Shizuoka, Japan) ,  Kaweewan I. (Graduate School of Integrated Science and Technology, Shizuoka University, Suruga-ku, Shizuoka, Japan) ,  Ohnishi-Kameyama M. (Food Research Institute, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Kodani S. (Graduate School of Integrated Science and Technology, Shizuoka University, Suruga-ku, Shizuoka, Japan) ,  Kodani S. (College of Agriculture, Academic Institute, Shizuoka University, Suruga-ku, Shizuoka, Japan) ,  Kodani S. (Graduate School of Science and Technology, Shizuoka University, Suruga-ku, Shizuoka, Japan)
資料名： Letters in Applied Microbiology  (Letters in Applied Microbiology)
巻： 64  号： 2  ページ： 150-157  発行年： 2017年 
JST資料番号： C0081C  ISSN： 0266-8254  CODEN： LAMIE7  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムマイニングに基づいて,actinokineosinと名付けた新しい抗細菌性ペプチドは稀な放線菌Actinokineospora spheciospongiaeから単離した。actinokineosinのC末端のアミノ酸配列は,TOF MS/MS実験により確立した。マクロラクタム環のアミノ酸配列はBNPSスカトールおよび連続トリプシン処理によって開裂した後にTOF MS/MS分析により決定した。ペーパーディスクを用いた抗菌アッセイの結果,actinokineosinはディスク当たり50μgの用量でMicrococcus luteusに対して抗菌活性を示した。A.spheciospongiaeのゲノム配列データから,actinokineosinの生合成遺伝子クラスターが見出され,10遺伝子から構成されていることが示唆された。遺伝子の中で,遺伝子aknAはactinokineosinの前駆体をコードし,aknC,aknB1とaknB2を含む遺伝子は成熟actinokineosinを修飾酵素として提案した。研究の意義と影響:ゲノムマイニングは,ゲノムデータベースからの新しい生物活性化合物を見出すための強力なツールである。本報告では,ゲノムマイニングに基づくactinokineosinと命名された新しい抗菌性ペプチドの単離と構造決定に成功した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： Micrococcus luteus ,  抗細菌作用 ,  遺伝子 ,  アミノ酸配列 ,  *ペプチド ,  前駆体 ,  トリプシン ,  生合成 ,  放線菌類 ,  円板 ,  *単離
準シソーラス用語： 遺伝子クラスタ ,  ゲノム配列 ,  *抗菌ペプチド ,  *ゲノムマイニング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Actinokineospora spheciospongiae ,  抗菌 ,  biosynthesis ,  BNPSスカトール ,  lassoペプチド ,  TOF MS/MS

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  代謝と栄養  (EG03054K) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (3件)： ゲノムマイニング ,  抗菌性ペプチド ,  単離