文献

J-GLOBAL ID：201602283304162501   整理番号：16A1277822

次世代シーケンサーデータの解析手法 第8回 アセンブリ後の解析

Methods for analyzing next-generation sequencing data: VIII. Post-assembly analysis

著者 (7件)： 谷澤靖洋 (遺伝学研 生命情報研究セ) ,  神沼英里 (遺伝学研 生命情報研究セ) ,  中村保一 (遺伝学研 生命情報研究セ) ,  遠野雅徳 (農業・食品産業技術総合研究機構) ,  寺田朋子 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  清水謙多郎 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  門田幸二 (東大 大学院農学生命科学研究科)
資料名： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
巻： 27  号： 3  ページ： 187-195  発行年： 2016年11月18日 
JST資料番号： L3534A  ISSN： 1343-327X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： de novoゲノムアセンブリ結果から,概要・完全配列(dr...

シソーラス用語： *自動分析計 ,...
準シソーラス用語： ゲノムアセンブリ ,...

ログイン（無料）して見る     続きはJDreamIII（有料）にて  {{ this.onShowAbsJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=16A1277822&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=L3534A") }}

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物・ウイルス学研究法一般  (EG02010V)

引用文献 (29件)：

• 1) Tanizawa Y, Tohno M, Kaminuma E, Nakamura Y, Arita M. (2015) Complete genome sequence and analysis of Lactobacillus hokkaidonensis LOOC260^T, a psychrotrophic lactic acid bacterium isolated from silage. BMC Genomics 16: 240.
• 2) Flusberg BA1, Webster DR, Lee JH, Travers KJ, Olivares EC, et al. (2010) Direct detection of DNA methylation during single-molecule, real-time sequencing. Nat Methods 7: 461-465.
• 3) Chin CS, Alexander DH, Marks P, Klammer AA, Drake J, et al. (2013) Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data. Nat Methods 10: 563-569.
• 4) Nagasaki H, Mochizuki T, Kodama Y, Saruhashi S, Morizaki S, et al. (2013) DDBJ read annotation pipeline: a cloud computing-based pipeline for high-throughput analysis of next-generation sequencing data. DNA Res 20: 383-390.
• 5) 谷澤靖洋,神沼英里,中村保一,遠野雅徳、大崎研、清水謙多郎,門田幸二.(2016)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 7 回ロン グリードアセンブリ.日本乳酸菌学会誌 27: 101-110.

タイトルに関連する用語 (4件)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  アセンブリ ,  解析