トリプシン保護膜貫通セグメントの解析に基づいた膜蛋白質の大規模同定【Powered by NICT】

Vit O.; Man P.; Man P.; Kadek A.; Kadek A.; Hausner J.; Hausner J.; Sklenar J.; Harant K.; Novak P.; Novak P.; Scigelova M.; Woffendin G.; Petrak J.

文献

J-GLOBAL ID：201702232847558093 整理番号：17A0377143

トリプシン保護膜貫通セグメントの解析に基づいた膜蛋白質の大規模同定【Powered by NICT】

Large-scale identification of membrane proteins based on analysis of trypsin-protected transmembrane segments

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資料名：
巻： 149 ページ： 15-22 発行年： 2016年
JST資料番号： T0073A ISSN： 1874-3919 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

内在性膜蛋白質は一般的にルーチンプロテオーム分析における過小評価,大部分はそれらの比較的低い豊度,疎水性とトリプシン開裂部位のためである。膜プロテオームの被覆率を増加させるために,種々の戦略が開発され,大部分が膜蛋白質の外膜セグメントを対象としてきた。は見落とされていた疎水性膜貫通セグメントに注目した。このようなペプチドは簡単な遠心分離法により分離した膜の炭酸塩ストリッピングとプロテアーゼ「シェービング」後に単離できた。埋め込まれた疎水性ペプチドで処理した膜は,CNBrによりRe消化,脱脂及びLC-MS/MS分析を受ける有機溶媒中で可溶化される。独自の「hppK」法を修正し,ヒトリンパ腫細胞の解析のためにそれを適用した。の二三は1 16膜貫通セグメントを持つIMPは1224蛋白質を同定した。この方法は蛋白質レベルには以前の証拠と13「失われた蛋白質」蛋白質の同定を可能にした。内在性膜蛋白質は多くの必須の機能を実行し,真核生物プロテオームのかなりの部分を代表している。その機能と発現に関する我々の知識は,限られている。膜プロテオームに関する我々の知識を拡張する新しいアプローチは非常に望まれている。ここで示すように,内在性膜蛋白質のかなり見落とされた疎水性膜貫通セグメントを標的とする新しい方法を膜プロテオームに及ぼす欠落情報を提供する広い可能性を持っている。同定を供給し,また,いわゆる「失われた蛋白質」を含む百種類の内在性膜蛋白質の定量化できる可能性があることを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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著者キーワード (6件)： , , , , ,

蛋白質・ペプチド一般 , 生体膜一般 , 生物学的機能

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