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J-GLOBAL ID：201702254635631014   整理番号：17A0351629

シーサンパンナ-キュウリ1遺伝子の配列特性と発現を分析した。【JST・京大機械翻訳】

Sequence Characteristics and Expression Analysis of Cs-Psy1 in Cucumis sativus L. var. xishuangbannanesis Qi & Yuan

著者 (8件)： Lu Ping (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wang Jianren (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Li Xixiang (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Song Jiangping (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Qiu Yang (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Wang Haiping (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Xiaohui (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Shen Di (Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Zhiwu Yichuan Ziyuan Xuebao  (Zhiwu Yichuan Ziyuan Xuebao)
巻： 17  号： 6  ページ： 1050-1057  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2753A  ISSN： 1672-1810  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 西双版納キュウリは中国特有の果肉橙色のキュウリ変種であり、異なる生殖質間のΒ-カロテン含有量の差異は明らかである。PSYはカロテン生合成経路における第1の律速酵素である。本研究では,西双版納(キュウリ キュウリ)を用いて,西双版納 黄瓜八Qing(トマト)からのトマト(CS)のDNAとCDNA配列をクローン化し,5つのイントロンと6つのエキソンを含むDNABPの長さのDNA配列を得た。421アミノ酸をコード化した。PSY1が推定したアミノ酸配列は,このファミリーの2つの特徴的配列を含み,保存性が高い。この蛋白質は不安定な蛋白質であり、明らかなは水性領域にあり、膜貫通構造を予測していない。系統発生分析の結果、西双版納キュウリのCS-PSY1タンパクとメロンの相同性が高いことが分かった。栽培キュウリの深さ配列決定材料「9930」と「GY14」の配列との比較分析を行い、115のキュウリのリシークエンシングの結果と合わせて、5つのSNPが発見され、そのうち2つは開始コドンの上流27BPと971BPに位置し、3つはイントロン領域に位置している。そのうち、SNP4はリシークエンシングの19の西双版納キュウリにおける突然変異率は100%であり、96の栽培キュウリにおける特異性は5.3%であった。転写因子結合部位の予測結果により、普通の栽培キュウリのこの点に一つのCTAG MOTIFが存在し、西双版納のキュウリにおいてこの変異点が存在すると、このMOTIFが存在しないことが分かった。リアルタイム蛍光定量PCR法を用いて、CS-PSY1の発現量の変化傾向を分析した結果、キュウリの異なる果実発育段階において、この遺伝子の発現量はいずれも先に上昇し、その後低下する傾向があり、西双版納キュウリの発現量の差異は明らかであることが分かった。受粉後50日目に最大値に達し、果実発育初期における発現量の8倍多く、同時期の普通のキュウリの4倍多いが、普通のキュウリの発現量の全体的な変化は比較的に緩やかな。西双版納果実の果皮中の果皮の発現レベルは中果皮より高く、最高差は約5倍で、普通のキュウリの差異は明らかではなかった。これらの結果から,PSY1遺伝子が西双版納キュウリのΒ-カロテン蓄積に影響する可能性があることが示唆された。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 定量的PCR法 ,  メロン ,  クローン ,  アミノ酸配列 ,  相同性 ,  イントロン ,  トマト ,  果肉 ,  蛍光 ,  *キュウリ ,  DNA【核酸】
準シソーラス用語： 特異性 ,  系統解析 ,  DNA配列 ,  生合成経路 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Cucumis sativus L. var. xishuangbannanesis Qi & Yuan ,  Phytoene Synthase(Psy) ,  gene clone ,  qRT-PCR ,  gene expression

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： キュウリ ,  遺伝子 ,  発現 ,  分析