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J-GLOBAL ID：200902157806128684   整理番号：00A0492798

並列処理 並列化Barnes-Hut Tee Codeを用いた高精度なタンパク質分子動力学法プログラムの開発

Parallel Processing. Development of Molecular Dynamics Programs for Proteins with a Parallelized Barnes-Hut Tree Code.

著者 (4件)： 三十尾潔高 (情報数理研) ,  志沢由久 (情報数理研) ,  秋山泰 (新情報処理開発機構) ,  斎藤稔 (弘前大 理工)
資料名： 情報処理学会論文誌  (IPSJ Journal)
巻： 41  号： 5  ページ： 1538-1548  発行年： 2000年05月15日 
JST資料番号： Z0778A  ISSN： 0387-5806  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 並列化した多体問題用のBarnes-Hut tree cod...

シソーラス用語： *タンパク質 ,...

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分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  数値計算  (JE02000J) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

引用文献 (16件)：

• BARNES, J. A hierarchical O(N log N) force-calculation algorithm. Nature. 1986, 324, 446-449
• 斎藤稔. 蛋白質分子の分子動力学計算. 科学. 1991, 61, 822-824
• SAITO, M. Molecular dynamics simulations of proteins in water without the truncation of long-range Coulobm interactions. Molecular Simulation. 1992, 8, 321-333
• SAITO, M. Molecular dynamics simulations of proteins in solution: Artifacts caused by the cutoff approximation. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4055-4061
• SINGH, J. Load balancing and data locality in adaptive hierarchical N-body methods. Technical Report CSL-TR-92-505, Stanford University. 1992

タイトルに関連する用語 (6件)： 並列処理 ,  並列化 ,  TEE ,  タンパク質 ,  分子動力学法 ,  開発