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J-GLOBAL ID：200902163777901557   整理番号：99A0365982

タンパク質立体構造の配列および原子間距離による分類と非冗長化されたPDB代表タンパク質チェインデータベース(PDB-REPRDB)の作成

The classification of protein structures based on the sequential and structural similarity, and the construction of the database of representative protein chains (PDB-REPRDB).

著者 (4件)： 野口保 (新情報処理開発機構) ,  秋山泰 (新情報処理開発機構) ,  鬼塚健太郎 (新情報処理開発機構) ,  安藤誠 (新情報処理開発機構)
資料名： 情報処理学会論文誌  (IPSJ Journal)
巻： 40  号： SIG2(TOM1)  ページ： 117-128  発行年： 1999年02月15日 
JST資料番号： Z0778A  ISSN： 0387-5806  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 従来の近似的に配列の類似性(ID%)によるタンパク質立体構造...

シソーラス用語： *タンパク質 ,...

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分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  データベースシステム  (JD03030U) ,  演算方式  (JC02020Z)

引用文献 (12件)：

• BERNSTEIN, F. C. The Protein Data Bank: A Computer-based Archival File for Macromolecular Structures. J. Mol. Biol. 1997, 112, 535-542
• HOBOHM, U. Selection of a representative set of structures from the Brookhaven Protein Data Bank. Protein Science. 1992, 1, 409-417
• HOBOHM, U. Enlarged representative set of protein structures. Protein Science. 1994, 3, 522
• HOBOHM, U. PDB_SELECT: Representative list of PDB chain identifiers. http://www.sander.emb1-heidelberg.de/whatif/select
• HOLM, L. Touring protein fold space with Dali/FSSP. Nucl. Acids Res. 1998, 26, 316-319

タイトルに関連する用語 (8件)： タンパク質立体構造 ,  原子間距離 ,  分類 ,  冗長化 ,  PDB ,  タンパク質 ,  チェイン ,  データベース