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J-GLOBAL ID：200902164520095009   整理番号：99A0516818

並列処理 分子動力学法プログラムAMBERとBarnes-Hut tree codeの並列化による高速化

Parallel Processings. Parallelization and Performance Evaluation of MD Program AMBER and Barnes-Hut Tree Code.

著者 (7件)： 斎藤稔 (新情報処理開発機構) ,  三十尾潔高 (情報数理研) ,  志沢由久 (情報数理研) ,  丸川一志 (アロー) ,  秋山泰 (新情報処理開発機構) ,  野口保 (新情報処理開発機構) ,  鬼塚健太郎 (新情報処理開発機構)
資料名： 情報処理学会論文誌  (IPSJ Journal)
巻： 40  号： 5  ページ： 2142-2151  発行年： 1999年05月15日 
JST資料番号： Z0778A  ISSN： 0387-5806  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 分子動力学シミュレーションのプログラムを,分散メモリ型並列計...

シソーラス用語： *分子動力学 ,...

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分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  演算方式  (JC02020Z)

引用文献 (10件)：

• PEARLMAN, D. A. AMBER4. 1. 1995
• SATO, H. Parallelization of AMBER molecular dynamics program for the AP1000 highly parallel computer. Proc. SHPCC-92. 1992, 113-120
• TEZUKA, H. RWC PC Cluster II and its performance. IPSJ SIG Notes. 1998, 97-HPC-70-5, 25-30
• BARNES, J. A Hierarchical O (NlogN) force-calculation algorithm. Nature. 1986, 324, 446-449
• 斎藤稔. 蛋白質分子の分子動力学計算. 科学. 1991, 61, 822-824

タイトルに関連する用語 (5件)： 並列処理 ,  分子動力学法 ,  AMBER ,  並列化 ,  高速化