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J-GLOBAL ID：201002213985781741   整理番号：10A0319664

明確なDNAナノ構造中に構築した二本鎖の異なる張力を用いたDNAのメチル化の調節

Regulation of DNA Methylation Using Different Tensions of Double Strands Constructed in a Defined DNA Nanostructure

著者 (6件)： ENDO Masayuki (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  ENDO Masayuki (JST-CREST, Tokyo, JPN) ,  KATSUDA Yousuke (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  HIDAKA Kumi (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  SUGIYAMA Hiroshi (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  SUGIYAMA Hiroshi (JST-CREST, Tokyo, JPN)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 132  号： 5  ページ： 1592-1597  発行年： 2010年02月10日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 酵素を用いたDNA修飾では反応を促進するために特異的なDNA鎖の折り曲げが必要となる。DNAメチル化酵素であるEcoRIメチルトランスフェラーゼ(M.EcoRI)は反応過程で二本鎖DNA鎖を折り曲げ,GAATTC配列の2番目のアデニンが反転することが知られている。本研究では,緊張および弛緩状態の二重らせんを作製し,M.EcoRIのメチル基転移反応を調節して,メチル化に対する構造的効果を調べた。DNA折り紙法を用いて,緊張状態の64量体および弛緩状態の74量体の二本鎖DNAを含む二次元DNA足場(DNAフレーム)を作製した。二本鎖DNAおよび64量体と74量体の二本鎖DNAとM.EcoRIの複合体の異なる動態的変動が高速走査原子間力顕微鏡(AFM)画像により明らかになった。DNAフレーム内の二本鎖をM.EcoRIで処理し,制限酵素EcoRI(R.EcoRI)で消化した後にAFM解析を行ったところ,74量体の二本鎖DNAは64量体の二本鎖DNAに比べて効率的に切断されないことが示されたことから,メチル化は緊張状態の64量体の二本鎖DNAに比べて弛緩状態の74量体の二本鎖DNAにおいて選択的に起ることが示された。これはメチル化と特異的消化のリアルタイムPCRを用いた解析によっても支持された。以上より,M.EcoRIを用いたメチル基転移反応の過程における二本鎖DNAの折り曲げのための構造的柔軟性の重要性が示され,DNAメチル化はDNAフレームナノ構造内に構築された構造的に制御された二本鎖DNAを用いて調節され得ることが示された。

シソーラス用語： *ナノ構造 ,  DNA【核酸】 ,  張力 ,  原子間力顕微鏡 ,  メチル化 ,  DNAメチルトランスフェラーゼ

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (6件)： DNA ,  ナノ構造 ,  構築 ,  張力 ,  メチル化 ,  調節