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J-GLOBAL ID：201202205175799557   整理番号：12A0617099

モデル生成を用いた代謝ネットワークにおける極小活性パスウェイの列挙

Enumerating Minimal Active Metabolic Pathways by Model Generation

著者 (2件)： 宋剛秀 (新領域融合研究センター) ,  井上克巳 (国立情報学研究所/総合研究大学院大学情報学専攻)
資料名： 人工知能学会論文誌(Web)  (TJSAI (Web))
巻： 27  号： 3  ページ： 204-212 (J-STAGE)  発行年： 2012年 
JST資料番号： U0128A  ISSN： 1346-8030  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： システム生物学では化学反応の相互作用をネットワーク(パスウェ...

シソーラス用語： *ネットワーク ,...
準シソーラス用語： パスウェイ ,...

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分類 (3件)： 代謝一般  (EB02030C) ,  ネットワーク法  (KA03040X) ,  論理代数  (JB03000H)

引用文献 (27件)：

• [Beasley 07] Beasley, J. E. and Planes, F. J.: Recovering metabolic pathways via optimization, Bioinformatics, Vol. 23, No. 1, pp. 92-98 (2007)
• [Croes 06] Croes, D., Couche, F., Wodak, S. J., and Helden, van J.: Inferring meaningful pathways in weighted metabolic networks, Journal of Molecular Biology, Vol. 356, No. 1, pp. 222-236 (2006)
• [Ferguson 98] Ferguson, G. P., Totemeyer, S., MacLean, M. J., and Booth, I. R.: Methylglyoxal production in bacteria: suicide or survival?, Archives of Microbiology, Vol. 170, No. 4, pp. 209-218 (1998)
• [Figueiredo 08] Figueiredo, de L. F., Schuster, S., Kaleta, C., and Fell, D. A.: Can sugars be produced from fatty acids?; A test case for pathway analysis tools, Bioinformatics, Vol. 24, No. 22, pp. 2615-2621 (2008)
• [Freedberg 71] Freedberg, W. B., Kistler, W. S., and Lin, E. C. C.: Lethal synthesis of methylglyoxal by Escherichia coli during unregulated glycerol metabolism, Journal of Bacteriology, Vol. 108, No. 1, pp. 137-144 (1971)

タイトルに関連する用語 (4件)： モデル生成 ,  代謝ネットワーク ,  活性 ,  パス